Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
MmadhcQ99LS1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MmadhcQ99LS1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MmadhcQ99LS1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MmadhcQ99LS1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MmadhcQ99LS1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MmadhcQ99LS1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MmadhcQ99LS1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MmadhcQ99LS1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MmadhcQ99LS1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MmadhcQ99LS1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MmadhcQ99LS1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MmadhcQ99LS1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MmadhcQ99LS1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MmadhcQ99LS1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MmadhcQ99LS1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MmadhcQ99LS1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MmadhcQ99LS1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MmadhcQ99LS1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MmadhcQ99LS1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MmadhcQ99LS1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MmadhcQ99LS1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MmadhcQ99LS1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MmadhcQ99LS1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MmadhcQ99LS1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MmadhcQ99LS1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MmadhcQ99LS1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MmadhcQ99LS1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MmadhcQ99LS1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MmadhcQ99LS1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MmadhcQ99LS1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MmadhcQ99LS1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MmadhcQ99LS1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MmadhcQ99LS1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MmadhcQ99LS1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MmadhcQ99LS1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MmadhcQ99LS1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MmadhcQ99LS1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MmadhcQ99LS1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MmadhcQ99LS1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MmadhcQ99LS1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MmadhcQ99LS1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MmadhcQ99LS1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MmadhcQ99LS1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MmadhcQ99LS1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MmadhcQ99LS1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MmadhcQ99LS1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MmadhcQ99LS1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MmadhcQ99LS1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MmadhcQ99LS1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MmadhcQ99LS1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MmadhcQ99LS1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MmadhcQ99LS1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MmadhcQ99LS1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MmadhcQ99LS1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MmadhcQ99LS1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MmadhcQ99LS1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MmadhcQ99LS1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MmadhcQ99LS1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MmadhcQ99LS1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MmadhcQ99LS1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MmadhcQ99LS1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MmadhcQ99LS1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MmadhcQ99LS1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MmadhcQ99LS1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MmadhcQ99LS1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MmadhcQ99LS1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MmadhcQ99LS1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MmadhcQ99LS1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MmadhcQ99LS1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MmadhcQ99LS1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MmadhcQ99LS1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MmadhcQ99LS1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MmadhcQ99LS1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MmadhcQ99LS1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MmadhcQ99LS1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MmadhcQ99LS1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MmadhcQ99LS1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MmadhcQ99LS1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MmadhcQ99LS1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MmadhcQ99LS1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MmadhcQ99LS1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MmadhcQ99LS1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MmadhcQ99LS1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MmadhcQ99LS1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MmadhcQ99LS1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MmadhcQ99LS1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MmadhcQ99LS1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MmadhcQ99LS1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MmadhcQ99LS1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms