Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CsprsQ99388 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CsprsQ99388 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CsprsQ99388 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CsprsQ99388 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CsprsQ99388 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CsprsQ99388 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CsprsQ99388 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CsprsQ99388 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CsprsQ99388 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CsprsQ99388 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CsprsQ99388 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CsprsQ99388 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CsprsQ99388 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CsprsQ99388 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CsprsQ99388 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CsprsQ99388 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CsprsQ99388 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CsprsQ99388 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CsprsQ99388 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CsprsQ99388 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CsprsQ99388 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CsprsQ99388 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CsprsQ99388 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CsprsQ99388 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CsprsQ99388 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CsprsQ99388 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CsprsQ99388 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CsprsQ99388 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CsprsQ99388 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CsprsQ99388 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CsprsQ99388 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CsprsQ99388 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CsprsQ99388 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CsprsQ99388 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CsprsQ99388 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CsprsQ99388 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CsprsQ99388 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CsprsQ99388 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CsprsQ99388 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CsprsQ99388 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CsprsQ99388 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CsprsQ99388 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CsprsQ99388 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CsprsQ99388 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CsprsQ99388 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CsprsQ99388 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CsprsQ99388 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CsprsQ99388 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CsprsQ99388 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CsprsQ99388 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CsprsQ99388 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CsprsQ99388 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CsprsQ99388 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CsprsQ99388 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CsprsQ99388 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CsprsQ99388 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CsprsQ99388 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CsprsQ99388 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CsprsQ99388 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CsprsQ99388 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CsprsQ99388 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CsprsQ99388 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CsprsQ99388 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CsprsQ99388 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CsprsQ99388 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CsprsQ99388 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CsprsQ99388 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CsprsQ99388 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CsprsQ99388 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CsprsQ99388 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CsprsQ99388 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CsprsQ99388 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CsprsQ99388 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CsprsQ99388 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CsprsQ99388 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CsprsQ99388 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CsprsQ99388 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CsprsQ99388 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CsprsQ99388 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CsprsQ99388 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CsprsQ99388 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CsprsQ99388 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CsprsQ99388 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CsprsQ99388 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CsprsQ99388 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CsprsQ99388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CsprsQ99388 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CsprsQ99388 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CsprsQ99388 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CsprsQ99388 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CsprsQ99388 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CsprsQ99388 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms