Protein–RNA interactions for Protein: Q921E2

Rab31, Ras-related protein Rab-31, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab31Q921E2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rab31Q921E2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab31Q921E2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab31Q921E2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab31Q921E2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab31Q921E2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab31Q921E2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab31Q921E2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab31Q921E2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab31Q921E2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab31Q921E2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab31Q921E2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab31Q921E2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab31Q921E2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab31Q921E2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab31Q921E2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab31Q921E2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab31Q921E2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab31Q921E2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab31Q921E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab31Q921E2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab31Q921E2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab31Q921E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab31Q921E2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab31Q921E2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab31Q921E2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab31Q921E2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab31Q921E2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab31Q921E2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab31Q921E2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab31Q921E2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab31Q921E2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab31Q921E2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab31Q921E2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab31Q921E2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab31Q921E2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab31Q921E2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab31Q921E2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab31Q921E2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab31Q921E2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab31Q921E2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab31Q921E2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab31Q921E2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab31Q921E2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab31Q921E2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab31Q921E2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab31Q921E2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab31Q921E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab31Q921E2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab31Q921E2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab31Q921E2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab31Q921E2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab31Q921E2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab31Q921E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab31Q921E2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab31Q921E2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab31Q921E2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab31Q921E2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab31Q921E2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab31Q921E2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab31Q921E2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab31Q921E2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab31Q921E2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab31Q921E2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab31Q921E2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab31Q921E2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab31Q921E2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab31Q921E2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab31Q921E2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab31Q921E2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab31Q921E2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab31Q921E2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab31Q921E2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab31Q921E2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab31Q921E2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab31Q921E2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab31Q921E2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab31Q921E2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab31Q921E2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab31Q921E2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab31Q921E2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab31Q921E2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab31Q921E2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab31Q921E2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab31Q921E2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab31Q921E2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab31Q921E2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab31Q921E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab31Q921E2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab31Q921E2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab31Q921E2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab31Q921E2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab31Q921E2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab31Q921E2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms