Protein–RNA interactions for Protein: Q91WQ9

Calml4, Calmodulin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml4Q91WQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Calml4Q91WQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Calml4Q91WQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Calml4Q91WQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Calml4Q91WQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Calml4Q91WQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Calml4Q91WQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Calml4Q91WQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Calml4Q91WQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Calml4Q91WQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Calml4Q91WQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Calml4Q91WQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Calml4Q91WQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Calml4Q91WQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Calml4Q91WQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Calml4Q91WQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Calml4Q91WQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Calml4Q91WQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Calml4Q91WQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Calml4Q91WQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Calml4Q91WQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Calml4Q91WQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Calml4Q91WQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Calml4Q91WQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Calml4Q91WQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Calml4Q91WQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Calml4Q91WQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Calml4Q91WQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Calml4Q91WQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Calml4Q91WQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Calml4Q91WQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Calml4Q91WQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Calml4Q91WQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Calml4Q91WQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Calml4Q91WQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Calml4Q91WQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Calml4Q91WQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Calml4Q91WQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Calml4Q91WQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Calml4Q91WQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Calml4Q91WQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Calml4Q91WQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Calml4Q91WQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Calml4Q91WQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Calml4Q91WQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Calml4Q91WQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Calml4Q91WQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Calml4Q91WQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Calml4Q91WQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Calml4Q91WQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Calml4Q91WQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Calml4Q91WQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Calml4Q91WQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Calml4Q91WQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Calml4Q91WQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Calml4Q91WQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Calml4Q91WQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Calml4Q91WQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Calml4Q91WQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Calml4Q91WQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Calml4Q91WQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Calml4Q91WQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Calml4Q91WQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Calml4Q91WQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Calml4Q91WQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Calml4Q91WQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Calml4Q91WQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Calml4Q91WQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Calml4Q91WQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calml4Q91WQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Calml4Q91WQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Calml4Q91WQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Calml4Q91WQ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Calml4Q91WQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Calml4Q91WQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Calml4Q91WQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Calml4Q91WQ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Calml4Q91WQ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Calml4Q91WQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Calml4Q91WQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Calml4Q91WQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Calml4Q91WQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Calml4Q91WQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Calml4Q91WQ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Calml4Q91WQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calml4Q91WQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calml4Q91WQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Calml4Q91WQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Calml4Q91WQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Calml4Q91WQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Calml4Q91WQ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Calml4Q91WQ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Calml4Q91WQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Calml4Q91WQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calml4Q91WQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Calml4Q91WQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Calml4Q91WQ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms