Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacng5Q8VHW4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacng5Q8VHW4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cacng5Q8VHW4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacng5Q8VHW4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacng5Q8VHW4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacng5Q8VHW4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng5Q8VHW4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacng5Q8VHW4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacng5Q8VHW4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacng5Q8VHW4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacng5Q8VHW4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacng5Q8VHW4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacng5Q8VHW4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacng5Q8VHW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacng5Q8VHW4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacng5Q8VHW4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacng5Q8VHW4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng5Q8VHW4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacng5Q8VHW4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacng5Q8VHW4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacng5Q8VHW4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacng5Q8VHW4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacng5Q8VHW4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng5Q8VHW4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng5Q8VHW4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacng5Q8VHW4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacng5Q8VHW4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng5Q8VHW4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacng5Q8VHW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacng5Q8VHW4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacng5Q8VHW4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacng5Q8VHW4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacng5Q8VHW4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng5Q8VHW4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacng5Q8VHW4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng5Q8VHW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacng5Q8VHW4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacng5Q8VHW4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacng5Q8VHW4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacng5Q8VHW4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacng5Q8VHW4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng5Q8VHW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacng5Q8VHW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacng5Q8VHW4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacng5Q8VHW4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng5Q8VHW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacng5Q8VHW4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacng5Q8VHW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacng5Q8VHW4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacng5Q8VHW4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacng5Q8VHW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacng5Q8VHW4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacng5Q8VHW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng5Q8VHW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng5Q8VHW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng5Q8VHW4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng5Q8VHW4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng5Q8VHW4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng5Q8VHW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacng5Q8VHW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng5Q8VHW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng5Q8VHW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng5Q8VHW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng5Q8VHW4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng5Q8VHW4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacng5Q8VHW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng5Q8VHW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng5Q8VHW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng5Q8VHW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng5Q8VHW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng5Q8VHW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng5Q8VHW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng5Q8VHW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacng5Q8VHW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng5Q8VHW4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng5Q8VHW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng5Q8VHW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng5Q8VHW4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacng5Q8VHW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacng5Q8VHW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacng5Q8VHW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacng5Q8VHW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacng5Q8VHW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacng5Q8VHW4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng5Q8VHW4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacng5Q8VHW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng5Q8VHW4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms