Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D9

Vmn1r32, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r32Q8R2D9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vmn1r32Q8R2D9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Vmn1r32Q8R2D9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vmn1r32Q8R2D9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vmn1r32Q8R2D9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Vmn1r32Q8R2D9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vmn1r32Q8R2D9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn1r32Q8R2D9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vmn1r32Q8R2D9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vmn1r32Q8R2D9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vmn1r32Q8R2D9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn1r32Q8R2D9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn1r32Q8R2D9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r32Q8R2D9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r32Q8R2D9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r32Q8R2D9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r32Q8R2D9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r32Q8R2D9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r32Q8R2D9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r32Q8R2D9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r32Q8R2D9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r32Q8R2D9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r32Q8R2D9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vmn1r32Q8R2D9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vmn1r32Q8R2D9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r32Q8R2D9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r32Q8R2D9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r32Q8R2D9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r32Q8R2D9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r32Q8R2D9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r32Q8R2D9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vmn1r32Q8R2D9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r32Q8R2D9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r32Q8R2D9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r32Q8R2D9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r32Q8R2D9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r32Q8R2D9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r32Q8R2D9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r32Q8R2D9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r32Q8R2D9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r32Q8R2D9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r32Q8R2D9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r32Q8R2D9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r32Q8R2D9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r32Q8R2D9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r32Q8R2D9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r32Q8R2D9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r32Q8R2D9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r32Q8R2D9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r32Q8R2D9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r32Q8R2D9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r32Q8R2D9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r32Q8R2D9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r32Q8R2D9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r32Q8R2D9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r32Q8R2D9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r32Q8R2D9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r32Q8R2D9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r32Q8R2D9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r32Q8R2D9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r32Q8R2D9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r32Q8R2D9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r32Q8R2D9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r32Q8R2D9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Vmn1r32Q8R2D9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r32Q8R2D9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r32Q8R2D9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r32Q8R2D9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r32Q8R2D9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r32Q8R2D9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r32Q8R2D9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r32Q8R2D9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r32Q8R2D9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r32Q8R2D9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r32Q8R2D9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r32Q8R2D9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r32Q8R2D9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r32Q8R2D9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r32Q8R2D9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r32Q8R2D9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r32Q8R2D9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r32Q8R2D9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r32Q8R2D9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r32Q8R2D9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn1r32Q8R2D9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r32Q8R2D9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r32Q8R2D9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r32Q8R2D9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r32Q8R2D9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r32Q8R2D9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r32Q8R2D9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r32Q8R2D9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r32Q8R2D9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r32Q8R2D9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r32Q8R2D9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms