Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W2

Gsg1, Germ cell-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsg1Q8R1W2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gsg1Q8R1W2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Gsg1Q8R1W2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gsg1Q8R1W2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gsg1Q8R1W2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Gsg1Q8R1W2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gsg1Q8R1W2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gsg1Q8R1W2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gsg1Q8R1W2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gsg1Q8R1W2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gsg1Q8R1W2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gsg1Q8R1W2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gsg1Q8R1W2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gsg1Q8R1W2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gsg1Q8R1W2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Gsg1Q8R1W2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gsg1Q8R1W2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gsg1Q8R1W2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gsg1Q8R1W2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gsg1Q8R1W2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gsg1Q8R1W2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gsg1Q8R1W2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gsg1Q8R1W2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gsg1Q8R1W2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gsg1Q8R1W2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gsg1Q8R1W2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gsg1Q8R1W2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gsg1Q8R1W2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gsg1Q8R1W2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gsg1Q8R1W2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gsg1Q8R1W2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gsg1Q8R1W2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gsg1Q8R1W2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gsg1Q8R1W2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gsg1Q8R1W2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gsg1Q8R1W2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gsg1Q8R1W2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gsg1Q8R1W2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gsg1Q8R1W2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gsg1Q8R1W2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gsg1Q8R1W2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gsg1Q8R1W2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gsg1Q8R1W2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gsg1Q8R1W2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Gsg1Q8R1W2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gsg1Q8R1W2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gsg1Q8R1W2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsg1Q8R1W2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gsg1Q8R1W2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gsg1Q8R1W2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gsg1Q8R1W2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gsg1Q8R1W2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gsg1Q8R1W2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gsg1Q8R1W2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gsg1Q8R1W2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gsg1Q8R1W2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gsg1Q8R1W2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gsg1Q8R1W2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gsg1Q8R1W2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gsg1Q8R1W2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gsg1Q8R1W2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsg1Q8R1W2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gsg1Q8R1W2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gsg1Q8R1W2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gsg1Q8R1W2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsg1Q8R1W2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsg1Q8R1W2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsg1Q8R1W2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gsg1Q8R1W2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gsg1Q8R1W2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gsg1Q8R1W2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gsg1Q8R1W2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gsg1Q8R1W2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gsg1Q8R1W2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gsg1Q8R1W2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gsg1Q8R1W2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gsg1Q8R1W2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gsg1Q8R1W2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gsg1Q8R1W2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gsg1Q8R1W2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gsg1Q8R1W2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gsg1Q8R1W2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gsg1Q8R1W2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gsg1Q8R1W2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gsg1Q8R1W2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gsg1Q8R1W2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gsg1Q8R1W2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gsg1Q8R1W2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gsg1Q8R1W2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gsg1Q8R1W2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gsg1Q8R1W2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gsg1Q8R1W2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gsg1Q8R1W2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gsg1Q8R1W2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gsg1Q8R1W2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gsg1Q8R1W2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gsg1Q8R1W2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gsg1Q8R1W2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gsg1Q8R1W2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gsg1Q8R1W2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms