Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Mcfd2Q8K5B2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Mcfd2Q8K5B2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mcfd2Q8K5B2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mcfd2Q8K5B2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Mcfd2Q8K5B2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mcfd2Q8K5B2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mcfd2Q8K5B2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mcfd2Q8K5B2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mcfd2Q8K5B2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mcfd2Q8K5B2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mcfd2Q8K5B2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mcfd2Q8K5B2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mcfd2Q8K5B2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mcfd2Q8K5B2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mcfd2Q8K5B2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Mcfd2Q8K5B2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcfd2Q8K5B2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcfd2Q8K5B2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Mcfd2Q8K5B2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mcfd2Q8K5B2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mcfd2Q8K5B2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mcfd2Q8K5B2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mcfd2Q8K5B2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mcfd2Q8K5B2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mcfd2Q8K5B2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mcfd2Q8K5B2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcfd2Q8K5B2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcfd2Q8K5B2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcfd2Q8K5B2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcfd2Q8K5B2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcfd2Q8K5B2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcfd2Q8K5B2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcfd2Q8K5B2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mcfd2Q8K5B2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcfd2Q8K5B2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcfd2Q8K5B2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcfd2Q8K5B2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Mcfd2Q8K5B2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mcfd2Q8K5B2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mcfd2Q8K5B2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mcfd2Q8K5B2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mcfd2Q8K5B2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mcfd2Q8K5B2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mcfd2Q8K5B2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mcfd2Q8K5B2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mcfd2Q8K5B2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mcfd2Q8K5B2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcfd2Q8K5B2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mcfd2Q8K5B2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcfd2Q8K5B2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcfd2Q8K5B2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcfd2Q8K5B2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcfd2Q8K5B2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcfd2Q8K5B2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mcfd2Q8K5B2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcfd2Q8K5B2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcfd2Q8K5B2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcfd2Q8K5B2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mcfd2Q8K5B2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcfd2Q8K5B2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcfd2Q8K5B2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcfd2Q8K5B2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcfd2Q8K5B2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcfd2Q8K5B2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcfd2Q8K5B2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcfd2Q8K5B2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcfd2Q8K5B2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcfd2Q8K5B2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcfd2Q8K5B2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcfd2Q8K5B2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcfd2Q8K5B2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcfd2Q8K5B2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcfd2Q8K5B2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcfd2Q8K5B2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcfd2Q8K5B2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mcfd2Q8K5B2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcfd2Q8K5B2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcfd2Q8K5B2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcfd2Q8K5B2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcfd2Q8K5B2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcfd2Q8K5B2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcfd2Q8K5B2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcfd2Q8K5B2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcfd2Q8K5B2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcfd2Q8K5B2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mcfd2Q8K5B2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcfd2Q8K5B2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mcfd2Q8K5B2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mcfd2Q8K5B2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms