Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3X4

Irf2bpl, Interferon regulatory factor 2-binding protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bplQ8K3X4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Irf2bplQ8K3X4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Irf2bplQ8K3X4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irf2bplQ8K3X4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Irf2bplQ8K3X4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Irf2bplQ8K3X4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irf2bplQ8K3X4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Irf2bplQ8K3X4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irf2bplQ8K3X4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irf2bplQ8K3X4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Irf2bplQ8K3X4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irf2bplQ8K3X4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Irf2bplQ8K3X4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf2bplQ8K3X4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf2bplQ8K3X4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Irf2bplQ8K3X4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irf2bplQ8K3X4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irf2bplQ8K3X4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irf2bplQ8K3X4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Irf2bplQ8K3X4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Irf2bplQ8K3X4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irf2bplQ8K3X4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Irf2bplQ8K3X4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf2bplQ8K3X4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf2bplQ8K3X4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irf2bplQ8K3X4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf2bplQ8K3X4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf2bplQ8K3X4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irf2bplQ8K3X4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irf2bplQ8K3X4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf2bplQ8K3X4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf2bplQ8K3X4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Irf2bplQ8K3X4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irf2bplQ8K3X4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irf2bplQ8K3X4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irf2bplQ8K3X4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irf2bplQ8K3X4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf2bplQ8K3X4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Irf2bplQ8K3X4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irf2bplQ8K3X4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf2bplQ8K3X4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf2bplQ8K3X4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf2bplQ8K3X4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf2bplQ8K3X4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf2bplQ8K3X4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf2bplQ8K3X4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf2bplQ8K3X4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf2bplQ8K3X4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf2bplQ8K3X4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf2bplQ8K3X4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf2bplQ8K3X4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf2bplQ8K3X4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf2bplQ8K3X4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf2bplQ8K3X4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf2bplQ8K3X4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf2bplQ8K3X4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf2bplQ8K3X4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf2bplQ8K3X4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf2bplQ8K3X4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf2bplQ8K3X4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf2bplQ8K3X4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf2bplQ8K3X4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf2bplQ8K3X4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf2bplQ8K3X4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf2bplQ8K3X4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf2bplQ8K3X4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf2bplQ8K3X4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf2bplQ8K3X4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf2bplQ8K3X4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf2bplQ8K3X4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf2bplQ8K3X4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf2bplQ8K3X4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf2bplQ8K3X4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf2bplQ8K3X4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf2bplQ8K3X4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf2bplQ8K3X4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf2bplQ8K3X4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf2bplQ8K3X4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf2bplQ8K3X4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf2bplQ8K3X4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irf2bplQ8K3X4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irf2bplQ8K3X4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irf2bplQ8K3X4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf2bplQ8K3X4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf2bplQ8K3X4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf2bplQ8K3X4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf2bplQ8K3X4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf2bplQ8K3X4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irf2bplQ8K3X4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf2bplQ8K3X4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Irf2bplQ8K3X4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf2bplQ8K3X4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf2bplQ8K3X4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf2bplQ8K3X4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf2bplQ8K3X4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms