Protein–RNA interactions for Protein: Q8K396

Mnd1, Meiotic nuclear division protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mnd1Q8K396 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Mnd1Q8K396 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mnd1Q8K396 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mnd1Q8K396 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Mnd1Q8K396 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Mnd1Q8K396 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mnd1Q8K396 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mnd1Q8K396 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mnd1Q8K396 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mnd1Q8K396 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mnd1Q8K396 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mnd1Q8K396 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mnd1Q8K396 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mnd1Q8K396 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mnd1Q8K396 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mnd1Q8K396 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mnd1Q8K396 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Mnd1Q8K396 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mnd1Q8K396 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mnd1Q8K396 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mnd1Q8K396 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mnd1Q8K396 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Mnd1Q8K396 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mnd1Q8K396 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mnd1Q8K396 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mnd1Q8K396 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mnd1Q8K396 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mnd1Q8K396 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Mnd1Q8K396 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Mnd1Q8K396 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mnd1Q8K396 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mnd1Q8K396 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Mnd1Q8K396 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mnd1Q8K396 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mnd1Q8K396 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mnd1Q8K396 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mnd1Q8K396 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mnd1Q8K396 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mnd1Q8K396 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mnd1Q8K396 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mnd1Q8K396 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mnd1Q8K396 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mnd1Q8K396 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mnd1Q8K396 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mnd1Q8K396 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mnd1Q8K396 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mnd1Q8K396 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mnd1Q8K396 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mnd1Q8K396 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mnd1Q8K396 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mnd1Q8K396 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mnd1Q8K396 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mnd1Q8K396 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mnd1Q8K396 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mnd1Q8K396 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mnd1Q8K396 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mnd1Q8K396 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mnd1Q8K396 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mnd1Q8K396 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mnd1Q8K396 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mnd1Q8K396 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mnd1Q8K396 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mnd1Q8K396 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mnd1Q8K396 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mnd1Q8K396 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mnd1Q8K396 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mnd1Q8K396 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mnd1Q8K396 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mnd1Q8K396 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mnd1Q8K396 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mnd1Q8K396 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mnd1Q8K396 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mnd1Q8K396 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mnd1Q8K396 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mnd1Q8K396 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mnd1Q8K396 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mnd1Q8K396 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mnd1Q8K396 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mnd1Q8K396 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mnd1Q8K396 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mnd1Q8K396 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mnd1Q8K396 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mnd1Q8K396 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mnd1Q8K396 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mnd1Q8K396 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mnd1Q8K396 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mnd1Q8K396 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mnd1Q8K396 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mnd1Q8K396 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mnd1Q8K396 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mnd1Q8K396 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mnd1Q8K396 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mnd1Q8K396 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mnd1Q8K396 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mnd1Q8K396 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms