Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Commd9Q8K2Q0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Commd9Q8K2Q0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Commd9Q8K2Q0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Commd9Q8K2Q0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Commd9Q8K2Q0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Commd9Q8K2Q0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Commd9Q8K2Q0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Commd9Q8K2Q0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Commd9Q8K2Q0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Commd9Q8K2Q0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Commd9Q8K2Q0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Commd9Q8K2Q0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Commd9Q8K2Q0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Commd9Q8K2Q0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Commd9Q8K2Q0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Commd9Q8K2Q0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Commd9Q8K2Q0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Commd9Q8K2Q0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd9Q8K2Q0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Commd9Q8K2Q0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Commd9Q8K2Q0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Commd9Q8K2Q0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Commd9Q8K2Q0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Commd9Q8K2Q0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Commd9Q8K2Q0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Commd9Q8K2Q0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Commd9Q8K2Q0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Commd9Q8K2Q0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Commd9Q8K2Q0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Commd9Q8K2Q0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Commd9Q8K2Q0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Commd9Q8K2Q0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Commd9Q8K2Q0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Commd9Q8K2Q0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Commd9Q8K2Q0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Commd9Q8K2Q0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Commd9Q8K2Q0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Commd9Q8K2Q0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Commd9Q8K2Q0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Commd9Q8K2Q0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Commd9Q8K2Q0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Commd9Q8K2Q0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Commd9Q8K2Q0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Commd9Q8K2Q0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Commd9Q8K2Q0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Commd9Q8K2Q0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd9Q8K2Q0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd9Q8K2Q0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Commd9Q8K2Q0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd9Q8K2Q0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Commd9Q8K2Q0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Commd9Q8K2Q0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Commd9Q8K2Q0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Commd9Q8K2Q0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Commd9Q8K2Q0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Commd9Q8K2Q0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Commd9Q8K2Q0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Commd9Q8K2Q0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Commd9Q8K2Q0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Commd9Q8K2Q0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Commd9Q8K2Q0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Commd9Q8K2Q0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Commd9Q8K2Q0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Commd9Q8K2Q0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Commd9Q8K2Q0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Commd9Q8K2Q0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Commd9Q8K2Q0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Commd9Q8K2Q0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Commd9Q8K2Q0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Commd9Q8K2Q0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Commd9Q8K2Q0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Commd9Q8K2Q0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Commd9Q8K2Q0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Commd9Q8K2Q0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Commd9Q8K2Q0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Commd9Q8K2Q0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Commd9Q8K2Q0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Commd9Q8K2Q0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd9Q8K2Q0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Commd9Q8K2Q0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd9Q8K2Q0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Commd9Q8K2Q0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd9Q8K2Q0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd9Q8K2Q0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd9Q8K2Q0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd9Q8K2Q0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd9Q8K2Q0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd9Q8K2Q0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd9Q8K2Q0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd9Q8K2Q0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd9Q8K2Q0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd9Q8K2Q0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Commd9Q8K2Q0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Commd9Q8K2Q0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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