Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cmc2Q8K199 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cmc2Q8K199 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cmc2Q8K199 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cmc2Q8K199 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cmc2Q8K199 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cmc2Q8K199 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cmc2Q8K199 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cmc2Q8K199 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cmc2Q8K199 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cmc2Q8K199 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cmc2Q8K199 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cmc2Q8K199 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmc2Q8K199 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmc2Q8K199 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cmc2Q8K199 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cmc2Q8K199 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmc2Q8K199 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cmc2Q8K199 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cmc2Q8K199 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmc2Q8K199 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cmc2Q8K199 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cmc2Q8K199 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmc2Q8K199 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cmc2Q8K199 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmc2Q8K199 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cmc2Q8K199 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmc2Q8K199 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmc2Q8K199 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cmc2Q8K199 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmc2Q8K199 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmc2Q8K199 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmc2Q8K199 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmc2Q8K199 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc2Q8K199 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc2Q8K199 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cmc2Q8K199 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmc2Q8K199 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmc2Q8K199 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmc2Q8K199 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmc2Q8K199 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmc2Q8K199 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmc2Q8K199 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmc2Q8K199 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmc2Q8K199 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmc2Q8K199 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmc2Q8K199 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmc2Q8K199 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmc2Q8K199 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmc2Q8K199 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmc2Q8K199 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmc2Q8K199 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmc2Q8K199 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cmc2Q8K199 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cmc2Q8K199 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmc2Q8K199 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cmc2Q8K199 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cmc2Q8K199 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cmc2Q8K199 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cmc2Q8K199 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmc2Q8K199 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmc2Q8K199 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmc2Q8K199 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmc2Q8K199 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmc2Q8K199 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmc2Q8K199 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmc2Q8K199 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmc2Q8K199 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmc2Q8K199 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmc2Q8K199 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmc2Q8K199 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmc2Q8K199 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmc2Q8K199 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmc2Q8K199 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmc2Q8K199 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmc2Q8K199 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmc2Q8K199 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmc2Q8K199 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmc2Q8K199 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmc2Q8K199 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmc2Q8K199 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmc2Q8K199 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmc2Q8K199 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmc2Q8K199 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmc2Q8K199 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmc2Q8K199 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmc2Q8K199 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmc2Q8K199 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmc2Q8K199 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmc2Q8K199 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmc2Q8K199 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmc2Q8K199 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmc2Q8K199 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmc2Q8K199 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmc2Q8K199 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmc2Q8K199 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmc2Q8K199 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmc2Q8K199 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms