Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Lrrc9Q8CDN9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Lrrc9Q8CDN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Lrrc9Q8CDN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Lrrc9Q8CDN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
Lrrc9Q8CDN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Lrrc9Q8CDN9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Lrrc9Q8CDN9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Lrrc9Q8CDN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Lrrc9Q8CDN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Lrrc9Q8CDN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Lrrc9Q8CDN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Lrrc9Q8CDN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Lrrc9Q8CDN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Lrrc9Q8CDN9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Lrrc9Q8CDN9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Lrrc9Q8CDN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Lrrc9Q8CDN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Lrrc9Q8CDN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Lrrc9Q8CDN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Lrrc9Q8CDN9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Lrrc9Q8CDN9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Lrrc9Q8CDN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Lrrc9Q8CDN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Lrrc9Q8CDN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Lrrc9Q8CDN9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Lrrc9Q8CDN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Lrrc9Q8CDN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Lrrc9Q8CDN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Lrrc9Q8CDN9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Lrrc9Q8CDN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Lrrc9Q8CDN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Lrrc9Q8CDN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Lrrc9Q8CDN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Lrrc9Q8CDN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Lrrc9Q8CDN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Lrrc9Q8CDN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Lrrc9Q8CDN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Lrrc9Q8CDN9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Lrrc9Q8CDN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Lrrc9Q8CDN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Lrrc9Q8CDN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Lrrc9Q8CDN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Lrrc9Q8CDN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Lrrc9Q8CDN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Lrrc9Q8CDN9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Lrrc9Q8CDN9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Lrrc9Q8CDN9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Lrrc9Q8CDN9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Lrrc9Q8CDN9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Lrrc9Q8CDN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Lrrc9Q8CDN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lrrc9Q8CDN9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Lrrc9Q8CDN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Lrrc9Q8CDN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Lrrc9Q8CDN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Lrrc9Q8CDN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Lrrc9Q8CDN9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Lrrc9Q8CDN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Lrrc9Q8CDN9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Lrrc9Q8CDN9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Lrrc9Q8CDN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Lrrc9Q8CDN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Lrrc9Q8CDN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Lrrc9Q8CDN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms