Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Lrif1Q8CDD9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrif1Q8CDD9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrif1Q8CDD9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lrif1Q8CDD9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrif1Q8CDD9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrif1Q8CDD9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrif1Q8CDD9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lrif1Q8CDD9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lrif1Q8CDD9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lrif1Q8CDD9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lrif1Q8CDD9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Lrif1Q8CDD9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lrif1Q8CDD9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lrif1Q8CDD9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrif1Q8CDD9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrif1Q8CDD9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrif1Q8CDD9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Lrif1Q8CDD9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrif1Q8CDD9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrif1Q8CDD9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrif1Q8CDD9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrif1Q8CDD9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrif1Q8CDD9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrif1Q8CDD9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrif1Q8CDD9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrif1Q8CDD9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrif1Q8CDD9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrif1Q8CDD9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrif1Q8CDD9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrif1Q8CDD9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrif1Q8CDD9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrif1Q8CDD9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrif1Q8CDD9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrif1Q8CDD9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrif1Q8CDD9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrif1Q8CDD9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrif1Q8CDD9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrif1Q8CDD9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrif1Q8CDD9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrif1Q8CDD9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrif1Q8CDD9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrif1Q8CDD9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrif1Q8CDD9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrif1Q8CDD9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrif1Q8CDD9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrif1Q8CDD9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrif1Q8CDD9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrif1Q8CDD9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrif1Q8CDD9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrif1Q8CDD9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrif1Q8CDD9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrif1Q8CDD9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrif1Q8CDD9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrif1Q8CDD9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrif1Q8CDD9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrif1Q8CDD9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrif1Q8CDD9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrif1Q8CDD9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrif1Q8CDD9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrif1Q8CDD9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrif1Q8CDD9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lrif1Q8CDD9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lrif1Q8CDD9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrif1Q8CDD9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrif1Q8CDD9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrif1Q8CDD9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrif1Q8CDD9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrif1Q8CDD9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrif1Q8CDD9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrif1Q8CDD9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrif1Q8CDD9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrif1Q8CDD9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrif1Q8CDD9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrif1Q8CDD9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrif1Q8CDD9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrif1Q8CDD9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrif1Q8CDD9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrif1Q8CDD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrif1Q8CDD9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrif1Q8CDD9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrif1Q8CDD9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrif1Q8CDD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrif1Q8CDD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrif1Q8CDD9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrif1Q8CDD9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lrif1Q8CDD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrif1Q8CDD9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrif1Q8CDD9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrif1Q8CDD9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrif1Q8CDD9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrif1Q8CDD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrif1Q8CDD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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