Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
A930004D18RikQ8C8W7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A930004D18RikQ8C8W7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A930004D18RikQ8C8W7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A930004D18RikQ8C8W7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
A930004D18RikQ8C8W7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A930004D18RikQ8C8W7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A930004D18RikQ8C8W7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A930004D18RikQ8C8W7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
A930004D18RikQ8C8W7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A930004D18RikQ8C8W7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A930004D18RikQ8C8W7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A930004D18RikQ8C8W7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A930004D18RikQ8C8W7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A930004D18RikQ8C8W7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A930004D18RikQ8C8W7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A930004D18RikQ8C8W7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A930004D18RikQ8C8W7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A930004D18RikQ8C8W7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A930004D18RikQ8C8W7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A930004D18RikQ8C8W7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A930004D18RikQ8C8W7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A930004D18RikQ8C8W7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A930004D18RikQ8C8W7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A930004D18RikQ8C8W7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A930004D18RikQ8C8W7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A930004D18RikQ8C8W7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A930004D18RikQ8C8W7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A930004D18RikQ8C8W7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A930004D18RikQ8C8W7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A930004D18RikQ8C8W7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A930004D18RikQ8C8W7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A930004D18RikQ8C8W7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A930004D18RikQ8C8W7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A930004D18RikQ8C8W7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A930004D18RikQ8C8W7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A930004D18RikQ8C8W7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A930004D18RikQ8C8W7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A930004D18RikQ8C8W7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A930004D18RikQ8C8W7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A930004D18RikQ8C8W7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930004D18RikQ8C8W7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A930004D18RikQ8C8W7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A930004D18RikQ8C8W7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A930004D18RikQ8C8W7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A930004D18RikQ8C8W7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A930004D18RikQ8C8W7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A930004D18RikQ8C8W7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A930004D18RikQ8C8W7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A930004D18RikQ8C8W7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A930004D18RikQ8C8W7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A930004D18RikQ8C8W7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A930004D18RikQ8C8W7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A930004D18RikQ8C8W7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A930004D18RikQ8C8W7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A930004D18RikQ8C8W7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A930004D18RikQ8C8W7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930004D18RikQ8C8W7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A930004D18RikQ8C8W7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
A930004D18RikQ8C8W7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A930004D18RikQ8C8W7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930004D18RikQ8C8W7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A930004D18RikQ8C8W7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A930004D18RikQ8C8W7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A930004D18RikQ8C8W7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A930004D18RikQ8C8W7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A930004D18RikQ8C8W7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A930004D18RikQ8C8W7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A930004D18RikQ8C8W7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A930004D18RikQ8C8W7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A930004D18RikQ8C8W7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A930004D18RikQ8C8W7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A930004D18RikQ8C8W7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A930004D18RikQ8C8W7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A930004D18RikQ8C8W7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A930004D18RikQ8C8W7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A930004D18RikQ8C8W7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A930004D18RikQ8C8W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A930004D18RikQ8C8W7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A930004D18RikQ8C8W7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A930004D18RikQ8C8W7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A930004D18RikQ8C8W7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A930004D18RikQ8C8W7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A930004D18RikQ8C8W7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms