Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Aph1bQ8C7N7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Aph1bQ8C7N7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Aph1bQ8C7N7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Aph1bQ8C7N7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Aph1bQ8C7N7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Aph1bQ8C7N7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Aph1bQ8C7N7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Aph1bQ8C7N7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Aph1bQ8C7N7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Aph1bQ8C7N7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aph1bQ8C7N7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Aph1bQ8C7N7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Aph1bQ8C7N7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Aph1bQ8C7N7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Aph1bQ8C7N7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Aph1bQ8C7N7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Aph1bQ8C7N7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Aph1bQ8C7N7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Aph1bQ8C7N7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Aph1bQ8C7N7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aph1bQ8C7N7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Aph1bQ8C7N7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Aph1bQ8C7N7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aph1bQ8C7N7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Aph1bQ8C7N7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Aph1bQ8C7N7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Aph1bQ8C7N7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Aph1bQ8C7N7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Aph1bQ8C7N7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Aph1bQ8C7N7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Aph1bQ8C7N7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Aph1bQ8C7N7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Aph1bQ8C7N7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Aph1bQ8C7N7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Aph1bQ8C7N7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aph1bQ8C7N7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Aph1bQ8C7N7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Aph1bQ8C7N7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aph1bQ8C7N7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aph1bQ8C7N7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aph1bQ8C7N7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Aph1bQ8C7N7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aph1bQ8C7N7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aph1bQ8C7N7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aph1bQ8C7N7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aph1bQ8C7N7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Aph1bQ8C7N7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Aph1bQ8C7N7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aph1bQ8C7N7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aph1bQ8C7N7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aph1bQ8C7N7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aph1bQ8C7N7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aph1bQ8C7N7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aph1bQ8C7N7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aph1bQ8C7N7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Aph1bQ8C7N7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Aph1bQ8C7N7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aph1bQ8C7N7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aph1bQ8C7N7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aph1bQ8C7N7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aph1bQ8C7N7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aph1bQ8C7N7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aph1bQ8C7N7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aph1bQ8C7N7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Aph1bQ8C7N7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Aph1bQ8C7N7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aph1bQ8C7N7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Aph1bQ8C7N7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aph1bQ8C7N7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aph1bQ8C7N7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aph1bQ8C7N7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aph1bQ8C7N7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aph1bQ8C7N7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aph1bQ8C7N7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aph1bQ8C7N7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aph1bQ8C7N7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aph1bQ8C7N7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Aph1bQ8C7N7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aph1bQ8C7N7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aph1bQ8C7N7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Aph1bQ8C7N7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aph1bQ8C7N7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aph1bQ8C7N7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aph1bQ8C7N7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aph1bQ8C7N7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aph1bQ8C7N7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aph1bQ8C7N7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aph1bQ8C7N7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aph1bQ8C7N7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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