Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cnot2Q8C5L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnot2Q8C5L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnot2Q8C5L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnot2Q8C5L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnot2Q8C5L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnot2Q8C5L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnot2Q8C5L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnot2Q8C5L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnot2Q8C5L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnot2Q8C5L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnot2Q8C5L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnot2Q8C5L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnot2Q8C5L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot2Q8C5L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot2Q8C5L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnot2Q8C5L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnot2Q8C5L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cnot2Q8C5L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnot2Q8C5L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnot2Q8C5L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot2Q8C5L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot2Q8C5L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnot2Q8C5L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnot2Q8C5L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnot2Q8C5L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot2Q8C5L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot2Q8C5L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot2Q8C5L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot2Q8C5L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot2Q8C5L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnot2Q8C5L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot2Q8C5L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnot2Q8C5L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot2Q8C5L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnot2Q8C5L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot2Q8C5L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot2Q8C5L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot2Q8C5L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnot2Q8C5L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnot2Q8C5L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnot2Q8C5L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnot2Q8C5L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnot2Q8C5L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnot2Q8C5L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot2Q8C5L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot2Q8C5L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot2Q8C5L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot2Q8C5L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot2Q8C5L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot2Q8C5L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnot2Q8C5L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot2Q8C5L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot2Q8C5L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot2Q8C5L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot2Q8C5L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot2Q8C5L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot2Q8C5L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnot2Q8C5L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot2Q8C5L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnot2Q8C5L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnot2Q8C5L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnot2Q8C5L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnot2Q8C5L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnot2Q8C5L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot2Q8C5L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot2Q8C5L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot2Q8C5L3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot2Q8C5L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnot2Q8C5L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnot2Q8C5L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot2Q8C5L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot2Q8C5L3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot2Q8C5L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot2Q8C5L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot2Q8C5L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot2Q8C5L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot2Q8C5L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot2Q8C5L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot2Q8C5L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot2Q8C5L3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot2Q8C5L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot2Q8C5L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot2Q8C5L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot2Q8C5L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot2Q8C5L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnot2Q8C5L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot2Q8C5L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot2Q8C5L3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot2Q8C5L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot2Q8C5L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot2Q8C5L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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