Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rae1Q8C570 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rae1Q8C570 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rae1Q8C570 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rae1Q8C570 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rae1Q8C570 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rae1Q8C570 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rae1Q8C570 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rae1Q8C570 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rae1Q8C570 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rae1Q8C570 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rae1Q8C570 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rae1Q8C570 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rae1Q8C570 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rae1Q8C570 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rae1Q8C570 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rae1Q8C570 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rae1Q8C570 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rae1Q8C570 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rae1Q8C570 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rae1Q8C570 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rae1Q8C570 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rae1Q8C570 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rae1Q8C570 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rae1Q8C570 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rae1Q8C570 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rae1Q8C570 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rae1Q8C570 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rae1Q8C570 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rae1Q8C570 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rae1Q8C570 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rae1Q8C570 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rae1Q8C570 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rae1Q8C570 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rae1Q8C570 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rae1Q8C570 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rae1Q8C570 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rae1Q8C570 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rae1Q8C570 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rae1Q8C570 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rae1Q8C570 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rae1Q8C570 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rae1Q8C570 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rae1Q8C570 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rae1Q8C570 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rae1Q8C570 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rae1Q8C570 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rae1Q8C570 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rae1Q8C570 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rae1Q8C570 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rae1Q8C570 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rae1Q8C570 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rae1Q8C570 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rae1Q8C570 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rae1Q8C570 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rae1Q8C570 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rae1Q8C570 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rae1Q8C570 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rae1Q8C570 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rae1Q8C570 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rae1Q8C570 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rae1Q8C570 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rae1Q8C570 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rae1Q8C570 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rae1Q8C570 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rae1Q8C570 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rae1Q8C570 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rae1Q8C570 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rae1Q8C570 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rae1Q8C570 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rae1Q8C570 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rae1Q8C570 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rae1Q8C570 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rae1Q8C570 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rae1Q8C570 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rae1Q8C570 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rae1Q8C570 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rae1Q8C570 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rae1Q8C570 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rae1Q8C570 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rae1Q8C570 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rae1Q8C570 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rae1Q8C570 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rae1Q8C570 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rae1Q8C570 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rae1Q8C570 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rae1Q8C570 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rae1Q8C570 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rae1Q8C570 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rae1Q8C570 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rae1Q8C570 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rae1Q8C570 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rae1Q8C570 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rae1Q8C570 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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