Protein–RNA interactions for Protein: Q8C186

Bpifc, BPI fold-containing family C protein, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BpifcQ8C186 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
BpifcQ8C186 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BpifcQ8C186 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BpifcQ8C186 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BpifcQ8C186 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BpifcQ8C186 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BpifcQ8C186 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BpifcQ8C186 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BpifcQ8C186 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BpifcQ8C186 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BpifcQ8C186 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BpifcQ8C186 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BpifcQ8C186 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BpifcQ8C186 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BpifcQ8C186 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BpifcQ8C186 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BpifcQ8C186 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BpifcQ8C186 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BpifcQ8C186 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BpifcQ8C186 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BpifcQ8C186 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BpifcQ8C186 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BpifcQ8C186 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BpifcQ8C186 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BpifcQ8C186 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BpifcQ8C186 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BpifcQ8C186 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BpifcQ8C186 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BpifcQ8C186 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BpifcQ8C186 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BpifcQ8C186 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BpifcQ8C186 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BpifcQ8C186 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BpifcQ8C186 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BpifcQ8C186 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BpifcQ8C186 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BpifcQ8C186 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BpifcQ8C186 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BpifcQ8C186 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BpifcQ8C186 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BpifcQ8C186 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BpifcQ8C186 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BpifcQ8C186 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BpifcQ8C186 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BpifcQ8C186 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BpifcQ8C186 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BpifcQ8C186 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BpifcQ8C186 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BpifcQ8C186 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BpifcQ8C186 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BpifcQ8C186 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BpifcQ8C186 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BpifcQ8C186 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BpifcQ8C186 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BpifcQ8C186 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BpifcQ8C186 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BpifcQ8C186 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BpifcQ8C186 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BpifcQ8C186 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BpifcQ8C186 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BpifcQ8C186 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BpifcQ8C186 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BpifcQ8C186 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BpifcQ8C186 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BpifcQ8C186 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BpifcQ8C186 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BpifcQ8C186 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BpifcQ8C186 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BpifcQ8C186 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BpifcQ8C186 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BpifcQ8C186 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BpifcQ8C186 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BpifcQ8C186 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BpifcQ8C186 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BpifcQ8C186 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BpifcQ8C186 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BpifcQ8C186 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BpifcQ8C186 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BpifcQ8C186 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BpifcQ8C186 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BpifcQ8C186 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BpifcQ8C186 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BpifcQ8C186 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BpifcQ8C186 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BpifcQ8C186 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BpifcQ8C186 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BpifcQ8C186 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BpifcQ8C186 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BpifcQ8C186 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BpifcQ8C186 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BpifcQ8C186 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BpifcQ8C186 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BpifcQ8C186 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms