Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhbdd3Q8BP97 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rhbdd3Q8BP97 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rhbdd3Q8BP97 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rhbdd3Q8BP97 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rhbdd3Q8BP97 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rhbdd3Q8BP97 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rhbdd3Q8BP97 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rhbdd3Q8BP97 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rhbdd3Q8BP97 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rhbdd3Q8BP97 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rhbdd3Q8BP97 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rhbdd3Q8BP97 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rhbdd3Q8BP97 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rhbdd3Q8BP97 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhbdd3Q8BP97 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rhbdd3Q8BP97 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rhbdd3Q8BP97 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rhbdd3Q8BP97 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rhbdd3Q8BP97 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rhbdd3Q8BP97 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rhbdd3Q8BP97 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rhbdd3Q8BP97 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rhbdd3Q8BP97 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rhbdd3Q8BP97 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rhbdd3Q8BP97 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rhbdd3Q8BP97 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rhbdd3Q8BP97 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rhbdd3Q8BP97 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rhbdd3Q8BP97 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdd3Q8BP97 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rhbdd3Q8BP97 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rhbdd3Q8BP97 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rhbdd3Q8BP97 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rhbdd3Q8BP97 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rhbdd3Q8BP97 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rhbdd3Q8BP97 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdd3Q8BP97 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rhbdd3Q8BP97 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rhbdd3Q8BP97 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rhbdd3Q8BP97 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rhbdd3Q8BP97 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdd3Q8BP97 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rhbdd3Q8BP97 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rhbdd3Q8BP97 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdd3Q8BP97 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rhbdd3Q8BP97 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdd3Q8BP97 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdd3Q8BP97 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdd3Q8BP97 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rhbdd3Q8BP97 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rhbdd3Q8BP97 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rhbdd3Q8BP97 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rhbdd3Q8BP97 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rhbdd3Q8BP97 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdd3Q8BP97 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rhbdd3Q8BP97 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rhbdd3Q8BP97 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rhbdd3Q8BP97 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rhbdd3Q8BP97 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Rhbdd3Q8BP97 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rhbdd3Q8BP97 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdd3Q8BP97 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rhbdd3Q8BP97 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rhbdd3Q8BP97 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rhbdd3Q8BP97 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rhbdd3Q8BP97 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdd3Q8BP97 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rhbdd3Q8BP97 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rhbdd3Q8BP97 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhbdd3Q8BP97 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhbdd3Q8BP97 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdd3Q8BP97 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhbdd3Q8BP97 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhbdd3Q8BP97 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhbdd3Q8BP97 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhbdd3Q8BP97 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rhbdd3Q8BP97 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhbdd3Q8BP97 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhbdd3Q8BP97 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhbdd3Q8BP97 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhbdd3Q8BP97 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhbdd3Q8BP97 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rhbdd3Q8BP97 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdd3Q8BP97 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdd3Q8BP97 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhbdd3Q8BP97 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhbdd3Q8BP97 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdd3Q8BP97 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdd3Q8BP97 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdd3Q8BP97 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdd3Q8BP97 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhbdd3Q8BP97 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdd3Q8BP97 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms