Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKH7

Mapkap1, Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mapkap1Q8BKH7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Mapkap1Q8BKH7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Mapkap1Q8BKH7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Mapkap1Q8BKH7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mapkap1Q8BKH7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Mapkap1Q8BKH7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Mapkap1Q8BKH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Mapkap1Q8BKH7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Mapkap1Q8BKH7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Mapkap1Q8BKH7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mapkap1Q8BKH7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mapkap1Q8BKH7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Mapkap1Q8BKH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mapkap1Q8BKH7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mapkap1Q8BKH7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Mapkap1Q8BKH7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mapkap1Q8BKH7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Mapkap1Q8BKH7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Mapkap1Q8BKH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mapkap1Q8BKH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mapkap1Q8BKH7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Mapkap1Q8BKH7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Mapkap1Q8BKH7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Mapkap1Q8BKH7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mapkap1Q8BKH7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mapkap1Q8BKH7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mapkap1Q8BKH7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mapkap1Q8BKH7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mapkap1Q8BKH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mapkap1Q8BKH7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mapkap1Q8BKH7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mapkap1Q8BKH7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mapkap1Q8BKH7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mapkap1Q8BKH7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mapkap1Q8BKH7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mapkap1Q8BKH7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mapkap1Q8BKH7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Mapkap1Q8BKH7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mapkap1Q8BKH7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mapkap1Q8BKH7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mapkap1Q8BKH7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mapkap1Q8BKH7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mapkap1Q8BKH7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Mapkap1Q8BKH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mapkap1Q8BKH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mapkap1Q8BKH7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mapkap1Q8BKH7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Mapkap1Q8BKH7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mapkap1Q8BKH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mapkap1Q8BKH7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mapkap1Q8BKH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mapkap1Q8BKH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mapkap1Q8BKH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mapkap1Q8BKH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mapkap1Q8BKH7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mapkap1Q8BKH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mapkap1Q8BKH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mapkap1Q8BKH7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mapkap1Q8BKH7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mapkap1Q8BKH7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mapkap1Q8BKH7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mapkap1Q8BKH7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mapkap1Q8BKH7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mapkap1Q8BKH7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mapkap1Q8BKH7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mapkap1Q8BKH7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mapkap1Q8BKH7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mapkap1Q8BKH7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mapkap1Q8BKH7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mapkap1Q8BKH7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mapkap1Q8BKH7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mapkap1Q8BKH7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mapkap1Q8BKH7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mapkap1Q8BKH7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Mapkap1Q8BKH7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mapkap1Q8BKH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mapkap1Q8BKH7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mapkap1Q8BKH7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mapkap1Q8BKH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mapkap1Q8BKH7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mapkap1Q8BKH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mapkap1Q8BKH7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mapkap1Q8BKH7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mapkap1Q8BKH7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mapkap1Q8BKH7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mapkap1Q8BKH7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mapkap1Q8BKH7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mapkap1Q8BKH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mapkap1Q8BKH7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mapkap1Q8BKH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mapkap1Q8BKH7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Mapkap1Q8BKH7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mapkap1Q8BKH7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mapkap1Q8BKH7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mapkap1Q8BKH7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mapkap1Q8BKH7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mapkap1Q8BKH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mapkap1Q8BKH7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mapkap1Q8BKH7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mapkap1Q8BKH7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms