Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH44

Coro2b, Coronin-2B, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro2bQ8BH44 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Coro2bQ8BH44 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Coro2bQ8BH44 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Coro2bQ8BH44 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Coro2bQ8BH44 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Coro2bQ8BH44 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Coro2bQ8BH44 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Coro2bQ8BH44 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Coro2bQ8BH44 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Coro2bQ8BH44 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Coro2bQ8BH44 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Coro2bQ8BH44 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Coro2bQ8BH44 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Coro2bQ8BH44 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Coro2bQ8BH44 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Coro2bQ8BH44 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Coro2bQ8BH44 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Coro2bQ8BH44 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Coro2bQ8BH44 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Coro2bQ8BH44 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Coro2bQ8BH44 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Coro2bQ8BH44 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Coro2bQ8BH44 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Coro2bQ8BH44 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Coro2bQ8BH44 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Coro2bQ8BH44 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Coro2bQ8BH44 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Coro2bQ8BH44 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Coro2bQ8BH44 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Coro2bQ8BH44 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Coro2bQ8BH44 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Coro2bQ8BH44 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Coro2bQ8BH44 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Coro2bQ8BH44 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Coro2bQ8BH44 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Coro2bQ8BH44 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Coro2bQ8BH44 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Coro2bQ8BH44 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Coro2bQ8BH44 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Coro2bQ8BH44 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Coro2bQ8BH44 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Coro2bQ8BH44 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Coro2bQ8BH44 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Coro2bQ8BH44 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Coro2bQ8BH44 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Coro2bQ8BH44 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Coro2bQ8BH44 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Coro2bQ8BH44 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Coro2bQ8BH44 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Coro2bQ8BH44 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Coro2bQ8BH44 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Coro2bQ8BH44 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Coro2bQ8BH44 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Coro2bQ8BH44 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Coro2bQ8BH44 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Coro2bQ8BH44 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Coro2bQ8BH44 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Coro2bQ8BH44 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Coro2bQ8BH44 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Coro2bQ8BH44 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Coro2bQ8BH44 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Coro2bQ8BH44 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Coro2bQ8BH44 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Coro2bQ8BH44 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Coro2bQ8BH44 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Coro2bQ8BH44 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Coro2bQ8BH44 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Coro2bQ8BH44 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Coro2bQ8BH44 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Coro2bQ8BH44 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Coro2bQ8BH44 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Coro2bQ8BH44 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Coro2bQ8BH44 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Coro2bQ8BH44 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Coro2bQ8BH44 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Coro2bQ8BH44 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Coro2bQ8BH44 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Coro2bQ8BH44 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Coro2bQ8BH44 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Coro2bQ8BH44 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Coro2bQ8BH44 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Coro2bQ8BH44 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Coro2bQ8BH44 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Coro2bQ8BH44 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Coro2bQ8BH44 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Coro2bQ8BH44 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Coro2bQ8BH44 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Coro2bQ8BH44 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Coro2bQ8BH44 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Coro2bQ8BH44 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Coro2bQ8BH44 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Coro2bQ8BH44 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Coro2bQ8BH44 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Coro2bQ8BH44 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms