Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SugctQ7TNE1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SugctQ7TNE1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SugctQ7TNE1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SugctQ7TNE1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SugctQ7TNE1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SugctQ7TNE1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SugctQ7TNE1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SugctQ7TNE1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SugctQ7TNE1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SugctQ7TNE1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SugctQ7TNE1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SugctQ7TNE1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SugctQ7TNE1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SugctQ7TNE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SugctQ7TNE1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SugctQ7TNE1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SugctQ7TNE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SugctQ7TNE1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SugctQ7TNE1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SugctQ7TNE1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SugctQ7TNE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SugctQ7TNE1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SugctQ7TNE1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SugctQ7TNE1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SugctQ7TNE1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SugctQ7TNE1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SugctQ7TNE1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SugctQ7TNE1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SugctQ7TNE1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SugctQ7TNE1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SugctQ7TNE1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SugctQ7TNE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SugctQ7TNE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SugctQ7TNE1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SugctQ7TNE1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SugctQ7TNE1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SugctQ7TNE1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SugctQ7TNE1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SugctQ7TNE1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SugctQ7TNE1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SugctQ7TNE1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SugctQ7TNE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SugctQ7TNE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SugctQ7TNE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SugctQ7TNE1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SugctQ7TNE1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SugctQ7TNE1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SugctQ7TNE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SugctQ7TNE1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SugctQ7TNE1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SugctQ7TNE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SugctQ7TNE1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SugctQ7TNE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SugctQ7TNE1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SugctQ7TNE1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SugctQ7TNE1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SugctQ7TNE1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SugctQ7TNE1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SugctQ7TNE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SugctQ7TNE1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SugctQ7TNE1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SugctQ7TNE1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SugctQ7TNE1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SugctQ7TNE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SugctQ7TNE1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SugctQ7TNE1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SugctQ7TNE1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SugctQ7TNE1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SugctQ7TNE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SugctQ7TNE1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SugctQ7TNE1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SugctQ7TNE1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SugctQ7TNE1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SugctQ7TNE1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SugctQ7TNE1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SugctQ7TNE1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SugctQ7TNE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SugctQ7TNE1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SugctQ7TNE1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SugctQ7TNE1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SugctQ7TNE1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SugctQ7TNE1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SugctQ7TNE1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SugctQ7TNE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SugctQ7TNE1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SugctQ7TNE1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SugctQ7TNE1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SugctQ7TNE1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SugctQ7TNE1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SugctQ7TNE1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SugctQ7TNE1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SugctQ7TNE1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SugctQ7TNE1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SugctQ7TNE1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SugctQ7TNE1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SugctQ7TNE1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SugctQ7TNE1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SugctQ7TNE1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SugctQ7TNE1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms