Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap1s3Q7TN05 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap1s3Q7TN05 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap1s3Q7TN05 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap1s3Q7TN05 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap1s3Q7TN05 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap1s3Q7TN05 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap1s3Q7TN05 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap1s3Q7TN05 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap1s3Q7TN05 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ap1s3Q7TN05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap1s3Q7TN05 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap1s3Q7TN05 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap1s3Q7TN05 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap1s3Q7TN05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap1s3Q7TN05 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap1s3Q7TN05 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ap1s3Q7TN05 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap1s3Q7TN05 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap1s3Q7TN05 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ap1s3Q7TN05 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap1s3Q7TN05 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap1s3Q7TN05 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ap1s3Q7TN05 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap1s3Q7TN05 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap1s3Q7TN05 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap1s3Q7TN05 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap1s3Q7TN05 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap1s3Q7TN05 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap1s3Q7TN05 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap1s3Q7TN05 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap1s3Q7TN05 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap1s3Q7TN05 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap1s3Q7TN05 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap1s3Q7TN05 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap1s3Q7TN05 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap1s3Q7TN05 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap1s3Q7TN05 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap1s3Q7TN05 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap1s3Q7TN05 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap1s3Q7TN05 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap1s3Q7TN05 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap1s3Q7TN05 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ap1s3Q7TN05 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap1s3Q7TN05 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap1s3Q7TN05 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap1s3Q7TN05 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap1s3Q7TN05 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap1s3Q7TN05 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap1s3Q7TN05 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap1s3Q7TN05 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap1s3Q7TN05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap1s3Q7TN05 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap1s3Q7TN05 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap1s3Q7TN05 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap1s3Q7TN05 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap1s3Q7TN05 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap1s3Q7TN05 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap1s3Q7TN05 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap1s3Q7TN05 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap1s3Q7TN05 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap1s3Q7TN05 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap1s3Q7TN05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap1s3Q7TN05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap1s3Q7TN05 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap1s3Q7TN05 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap1s3Q7TN05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap1s3Q7TN05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap1s3Q7TN05 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap1s3Q7TN05 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap1s3Q7TN05 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap1s3Q7TN05 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap1s3Q7TN05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap1s3Q7TN05 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ap1s3Q7TN05 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap1s3Q7TN05 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap1s3Q7TN05 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap1s3Q7TN05 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap1s3Q7TN05 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap1s3Q7TN05 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap1s3Q7TN05 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap1s3Q7TN05 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ap1s3Q7TN05 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ap1s3Q7TN05 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap1s3Q7TN05 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap1s3Q7TN05 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap1s3Q7TN05 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap1s3Q7TN05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap1s3Q7TN05 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap1s3Q7TN05 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms