Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE84

Stoml3, Stomatin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stoml3Q6PE84 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stoml3Q6PE84 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Stoml3Q6PE84 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stoml3Q6PE84 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stoml3Q6PE84 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stoml3Q6PE84 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Stoml3Q6PE84 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stoml3Q6PE84 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stoml3Q6PE84 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stoml3Q6PE84 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stoml3Q6PE84 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stoml3Q6PE84 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stoml3Q6PE84 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stoml3Q6PE84 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stoml3Q6PE84 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stoml3Q6PE84 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Stoml3Q6PE84 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stoml3Q6PE84 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Stoml3Q6PE84 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stoml3Q6PE84 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stoml3Q6PE84 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stoml3Q6PE84 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stoml3Q6PE84 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stoml3Q6PE84 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stoml3Q6PE84 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Stoml3Q6PE84 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stoml3Q6PE84 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stoml3Q6PE84 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stoml3Q6PE84 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stoml3Q6PE84 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stoml3Q6PE84 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stoml3Q6PE84 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stoml3Q6PE84 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stoml3Q6PE84 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stoml3Q6PE84 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stoml3Q6PE84 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stoml3Q6PE84 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stoml3Q6PE84 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stoml3Q6PE84 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stoml3Q6PE84 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Stoml3Q6PE84 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stoml3Q6PE84 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stoml3Q6PE84 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stoml3Q6PE84 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stoml3Q6PE84 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stoml3Q6PE84 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stoml3Q6PE84 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stoml3Q6PE84 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stoml3Q6PE84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stoml3Q6PE84 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stoml3Q6PE84 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stoml3Q6PE84 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stoml3Q6PE84 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stoml3Q6PE84 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stoml3Q6PE84 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stoml3Q6PE84 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stoml3Q6PE84 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stoml3Q6PE84 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stoml3Q6PE84 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stoml3Q6PE84 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stoml3Q6PE84 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stoml3Q6PE84 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stoml3Q6PE84 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stoml3Q6PE84 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stoml3Q6PE84 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stoml3Q6PE84 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stoml3Q6PE84 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stoml3Q6PE84 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stoml3Q6PE84 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stoml3Q6PE84 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stoml3Q6PE84 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stoml3Q6PE84 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stoml3Q6PE84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stoml3Q6PE84 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stoml3Q6PE84 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stoml3Q6PE84 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stoml3Q6PE84 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stoml3Q6PE84 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stoml3Q6PE84 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stoml3Q6PE84 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stoml3Q6PE84 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stoml3Q6PE84 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stoml3Q6PE84 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stoml3Q6PE84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stoml3Q6PE84 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stoml3Q6PE84 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stoml3Q6PE84 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stoml3Q6PE84 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stoml3Q6PE84 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stoml3Q6PE84 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stoml3Q6PE84 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stoml3Q6PE84 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stoml3Q6PE84 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stoml3Q6PE84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stoml3Q6PE84 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stoml3Q6PE84 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stoml3Q6PE84 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stoml3Q6PE84 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stoml3Q6PE84 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stoml3Q6PE84 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms