Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Spin2cQ6NVE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Spin2cQ6NVE3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Spin2cQ6NVE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spin2cQ6NVE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spin2cQ6NVE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spin2cQ6NVE3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spin2cQ6NVE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Spin2cQ6NVE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spin2cQ6NVE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Spin2cQ6NVE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spin2cQ6NVE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Spin2cQ6NVE3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spin2cQ6NVE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spin2cQ6NVE3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spin2cQ6NVE3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spin2cQ6NVE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spin2cQ6NVE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Spin2cQ6NVE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spin2cQ6NVE3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spin2cQ6NVE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Spin2cQ6NVE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spin2cQ6NVE3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Spin2cQ6NVE3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spin2cQ6NVE3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spin2cQ6NVE3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spin2cQ6NVE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spin2cQ6NVE3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spin2cQ6NVE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spin2cQ6NVE3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spin2cQ6NVE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spin2cQ6NVE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spin2cQ6NVE3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spin2cQ6NVE3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spin2cQ6NVE3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spin2cQ6NVE3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spin2cQ6NVE3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spin2cQ6NVE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spin2cQ6NVE3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spin2cQ6NVE3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Spin2cQ6NVE3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spin2cQ6NVE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spin2cQ6NVE3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spin2cQ6NVE3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spin2cQ6NVE3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spin2cQ6NVE3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spin2cQ6NVE3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spin2cQ6NVE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spin2cQ6NVE3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spin2cQ6NVE3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spin2cQ6NVE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spin2cQ6NVE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Spin2cQ6NVE3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spin2cQ6NVE3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spin2cQ6NVE3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spin2cQ6NVE3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spin2cQ6NVE3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spin2cQ6NVE3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spin2cQ6NVE3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spin2cQ6NVE3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spin2cQ6NVE3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spin2cQ6NVE3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spin2cQ6NVE3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin2cQ6NVE3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spin2cQ6NVE3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spin2cQ6NVE3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spin2cQ6NVE3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spin2cQ6NVE3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spin2cQ6NVE3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spin2cQ6NVE3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spin2cQ6NVE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spin2cQ6NVE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin2cQ6NVE3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin2cQ6NVE3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin2cQ6NVE3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2cQ6NVE3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spin2cQ6NVE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spin2cQ6NVE3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spin2cQ6NVE3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spin2cQ6NVE3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spin2cQ6NVE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spin2cQ6NVE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spin2cQ6NVE3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spin2cQ6NVE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms