Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Sh3gl2Q62420 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Sh3gl2Q62420 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sh3gl2Q62420 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sh3gl2Q62420 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sh3gl2Q62420 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sh3gl2Q62420 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Sh3gl2Q62420 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sh3gl2Q62420 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sh3gl2Q62420 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sh3gl2Q62420 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sh3gl2Q62420 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sh3gl2Q62420 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sh3gl2Q62420 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sh3gl2Q62420 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Sh3gl2Q62420 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Sh3gl2Q62420 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sh3gl2Q62420 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sh3gl2Q62420 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sh3gl2Q62420 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sh3gl2Q62420 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sh3gl2Q62420 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sh3gl2Q62420 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Sh3gl2Q62420 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Sh3gl2Q62420 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sh3gl2Q62420 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sh3gl2Q62420 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sh3gl2Q62420 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sh3gl2Q62420 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sh3gl2Q62420 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sh3gl2Q62420 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sh3gl2Q62420 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sh3gl2Q62420 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Sh3gl2Q62420 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sh3gl2Q62420 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sh3gl2Q62420 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Sh3gl2Q62420 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sh3gl2Q62420 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sh3gl2Q62420 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sh3gl2Q62420 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sh3gl2Q62420 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sh3gl2Q62420 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sh3gl2Q62420 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sh3gl2Q62420 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sh3gl2Q62420 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3gl2Q62420 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sh3gl2Q62420 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Sh3gl2Q62420 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sh3gl2Q62420 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sh3gl2Q62420 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sh3gl2Q62420 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3gl2Q62420 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3gl2Q62420 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3gl2Q62420 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sh3gl2Q62420 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3gl2Q62420 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3gl2Q62420 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Sh3gl2Q62420 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sh3gl2Q62420 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sh3gl2Q62420 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sh3gl2Q62420 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sh3gl2Q62420 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sh3gl2Q62420 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sh3gl2Q62420 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sh3gl2Q62420 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sh3gl2Q62420 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sh3gl2Q62420 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3gl2Q62420 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3gl2Q62420 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh3gl2Q62420 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sh3gl2Q62420 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh3gl2Q62420 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sh3gl2Q62420 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3gl2Q62420 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3gl2Q62420 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sh3gl2Q62420 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3gl2Q62420 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3gl2Q62420 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3gl2Q62420 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3gl2Q62420 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3gl2Q62420 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3gl2Q62420 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh3gl2Q62420 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh3gl2Q62420 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3gl2Q62420 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3gl2Q62420 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3gl2Q62420 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sh3gl2Q62420 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3gl2Q62420 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sh3gl2Q62420 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sh3gl2Q62420 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3gl2Q62420 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh3gl2Q62420 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3gl2Q62420 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sh3gl2Q62420 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sh3gl2Q62420 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3gl2Q62420 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3gl2Q62420 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3gl2Q62420 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh3gl2Q62420 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms