Protein–RNA interactions for Protein: Q62406

Irak1, Interleukin-1 receptor-associated kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak1Q62406 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Irak1Q62406 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Irak1Q62406 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Irak1Q62406 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Irak1Q62406 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Irak1Q62406 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Irak1Q62406 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Irak1Q62406 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Irak1Q62406 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Irak1Q62406 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Irak1Q62406 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Irak1Q62406 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Irak1Q62406 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Irak1Q62406 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Irak1Q62406 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Irak1Q62406 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Irak1Q62406 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Irak1Q62406 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Irak1Q62406 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Irak1Q62406 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Irak1Q62406 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Irak1Q62406 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Irak1Q62406 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Irak1Q62406 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Irak1Q62406 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Irak1Q62406 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irak1Q62406 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irak1Q62406 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Irak1Q62406 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Irak1Q62406 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irak1Q62406 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Irak1Q62406 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Irak1Q62406 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Irak1Q62406 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Irak1Q62406 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Irak1Q62406 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Irak1Q62406 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Irak1Q62406 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Irak1Q62406 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Irak1Q62406 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Irak1Q62406 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Irak1Q62406 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Irak1Q62406 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Irak1Q62406 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Irak1Q62406 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irak1Q62406 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irak1Q62406 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irak1Q62406 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irak1Q62406 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Irak1Q62406 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irak1Q62406 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irak1Q62406 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Irak1Q62406 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irak1Q62406 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Irak1Q62406 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irak1Q62406 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irak1Q62406 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irak1Q62406 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Irak1Q62406 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irak1Q62406 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Irak1Q62406 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irak1Q62406 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Irak1Q62406 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Irak1Q62406 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Irak1Q62406 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irak1Q62406 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irak1Q62406 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irak1Q62406 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Irak1Q62406 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irak1Q62406 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irak1Q62406 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Irak1Q62406 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irak1Q62406 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irak1Q62406 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irak1Q62406 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irak1Q62406 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irak1Q62406 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irak1Q62406 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irak1Q62406 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irak1Q62406 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Irak1Q62406 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Irak1Q62406 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Irak1Q62406 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irak1Q62406 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irak1Q62406 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Irak1Q62406 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irak1Q62406 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irak1Q62406 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irak1Q62406 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irak1Q62406 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irak1Q62406 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irak1Q62406 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irak1Q62406 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irak1Q62406 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irak1Q62406 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irak1Q62406 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irak1Q62406 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irak1Q62406 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irak1Q62406 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irak1Q62406 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms