Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sox19Q62249 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Sox19Q62249 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox19Q62249 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox19Q62249 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox19Q62249 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox19Q62249 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox19Q62249 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox19Q62249 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox19Q62249 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox19Q62249 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox19Q62249 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox19Q62249 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox19Q62249 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox19Q62249 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox19Q62249 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox19Q62249 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox19Q62249 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox19Q62249 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox19Q62249 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox19Q62249 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox19Q62249 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox19Q62249 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox19Q62249 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox19Q62249 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox19Q62249 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox19Q62249 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox19Q62249 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox19Q62249 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox19Q62249 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox19Q62249 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox19Q62249 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox19Q62249 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox19Q62249 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox19Q62249 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sox19Q62249 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox19Q62249 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox19Q62249 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox19Q62249 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox19Q62249 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox19Q62249 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox19Q62249 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox19Q62249 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox19Q62249 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox19Q62249 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox19Q62249 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox19Q62249 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox19Q62249 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox19Q62249 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox19Q62249 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox19Q62249 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox19Q62249 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox19Q62249 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox19Q62249 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox19Q62249 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox19Q62249 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox19Q62249 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox19Q62249 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox19Q62249 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox19Q62249 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox19Q62249 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox19Q62249 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox19Q62249 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox19Q62249 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox19Q62249 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox19Q62249 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox19Q62249 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox19Q62249 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox19Q62249 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox19Q62249 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox19Q62249 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox19Q62249 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox19Q62249 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox19Q62249 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox19Q62249 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox19Q62249 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox19Q62249 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox19Q62249 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox19Q62249 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox19Q62249 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox19Q62249 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox19Q62249 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox19Q62249 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox19Q62249 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox19Q62249 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox19Q62249 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox19Q62249 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox19Q62249 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox19Q62249 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox19Q62249 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox19Q62249 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox19Q62249 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox19Q62249 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox19Q62249 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox19Q62249 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox19Q62249 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox19Q62249 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox19Q62249 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox19Q62249 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox19Q62249 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms