Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Sema4bQ62179 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Sema4bQ62179 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sema4bQ62179 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Sema4bQ62179 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Sema4bQ62179 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sema4bQ62179 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sema4bQ62179 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sema4bQ62179 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sema4bQ62179 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sema4bQ62179 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sema4bQ62179 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sema4bQ62179 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sema4bQ62179 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sema4bQ62179 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sema4bQ62179 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sema4bQ62179 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Sema4bQ62179 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sema4bQ62179 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Sema4bQ62179 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sema4bQ62179 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sema4bQ62179 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sema4bQ62179 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sema4bQ62179 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sema4bQ62179 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Sema4bQ62179 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sema4bQ62179 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Sema4bQ62179 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sema4bQ62179 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sema4bQ62179 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sema4bQ62179 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sema4bQ62179 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sema4bQ62179 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sema4bQ62179 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sema4bQ62179 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sema4bQ62179 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sema4bQ62179 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sema4bQ62179 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sema4bQ62179 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Sema4bQ62179 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sema4bQ62179 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sema4bQ62179 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sema4bQ62179 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sema4bQ62179 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sema4bQ62179 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sema4bQ62179 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sema4bQ62179 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sema4bQ62179 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sema4bQ62179 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema4bQ62179 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema4bQ62179 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sema4bQ62179 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sema4bQ62179 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sema4bQ62179 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sema4bQ62179 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sema4bQ62179 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sema4bQ62179 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sema4bQ62179 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sema4bQ62179 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sema4bQ62179 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sema4bQ62179 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sema4bQ62179 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sema4bQ62179 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sema4bQ62179 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sema4bQ62179 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Sema4bQ62179 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sema4bQ62179 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sema4bQ62179 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sema4bQ62179 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sema4bQ62179 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sema4bQ62179 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sema4bQ62179 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sema4bQ62179 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sema4bQ62179 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sema4bQ62179 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema4bQ62179 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sema4bQ62179 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sema4bQ62179 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sema4bQ62179 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sema4bQ62179 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sema4bQ62179 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sema4bQ62179 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sema4bQ62179 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sema4bQ62179 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sema4bQ62179 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema4bQ62179 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sema4bQ62179 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sema4bQ62179 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sema4bQ62179 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema4bQ62179 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema4bQ62179 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema4bQ62179 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema4bQ62179 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema4bQ62179 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema4bQ62179 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema4bQ62179 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema4bQ62179 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sema4bQ62179 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema4bQ62179 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema4bQ62179 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms