Protein–RNA interactions for Protein: Q61070

Ei24, Etoposide-induced protein 2.4, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ei24Q61070 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ei24Q61070 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ei24Q61070 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ei24Q61070 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ei24Q61070 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ei24Q61070 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ei24Q61070 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ei24Q61070 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ei24Q61070 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ei24Q61070 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ei24Q61070 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ei24Q61070 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ei24Q61070 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ei24Q61070 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ei24Q61070 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ei24Q61070 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ei24Q61070 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ei24Q61070 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ei24Q61070 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ei24Q61070 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ei24Q61070 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ei24Q61070 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ei24Q61070 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ei24Q61070 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ei24Q61070 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ei24Q61070 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ei24Q61070 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ei24Q61070 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ei24Q61070 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ei24Q61070 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ei24Q61070 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ei24Q61070 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ei24Q61070 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ei24Q61070 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ei24Q61070 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ei24Q61070 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ei24Q61070 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ei24Q61070 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ei24Q61070 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ei24Q61070 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ei24Q61070 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ei24Q61070 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ei24Q61070 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ei24Q61070 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ei24Q61070 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ei24Q61070 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ei24Q61070 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ei24Q61070 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ei24Q61070 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ei24Q61070 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ei24Q61070 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ei24Q61070 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ei24Q61070 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ei24Q61070 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ei24Q61070 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ei24Q61070 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ei24Q61070 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ei24Q61070 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ei24Q61070 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ei24Q61070 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ei24Q61070 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ei24Q61070 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ei24Q61070 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ei24Q61070 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ei24Q61070 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ei24Q61070 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ei24Q61070 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ei24Q61070 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ei24Q61070 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ei24Q61070 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ei24Q61070 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ei24Q61070 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ei24Q61070 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ei24Q61070 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ei24Q61070 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ei24Q61070 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ei24Q61070 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ei24Q61070 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ei24Q61070 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ei24Q61070 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ei24Q61070 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ei24Q61070 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ei24Q61070 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ei24Q61070 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ei24Q61070 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ei24Q61070 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ei24Q61070 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ei24Q61070 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ei24Q61070 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ei24Q61070 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ei24Q61070 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ei24Q61070 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ei24Q61070 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ei24Q61070 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ei24Q61070 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms