Protein–RNA interactions for Protein: Q61011

Gnb3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb3Q61011 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gnb3Q61011 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gnb3Q61011 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gnb3Q61011 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gnb3Q61011 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gnb3Q61011 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gnb3Q61011 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gnb3Q61011 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gnb3Q61011 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gnb3Q61011 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gnb3Q61011 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gnb3Q61011 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gnb3Q61011 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gnb3Q61011 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gnb3Q61011 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gnb3Q61011 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gnb3Q61011 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gnb3Q61011 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gnb3Q61011 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gnb3Q61011 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gnb3Q61011 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gnb3Q61011 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gnb3Q61011 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gnb3Q61011 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gnb3Q61011 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gnb3Q61011 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gnb3Q61011 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnb3Q61011 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gnb3Q61011 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnb3Q61011 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnb3Q61011 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnb3Q61011 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnb3Q61011 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gnb3Q61011 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnb3Q61011 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnb3Q61011 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnb3Q61011 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gnb3Q61011 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gnb3Q61011 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gnb3Q61011 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gnb3Q61011 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gnb3Q61011 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gnb3Q61011 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gnb3Q61011 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnb3Q61011 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gnb3Q61011 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gnb3Q61011 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnb3Q61011 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnb3Q61011 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnb3Q61011 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnb3Q61011 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnb3Q61011 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnb3Q61011 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gnb3Q61011 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gnb3Q61011 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gnb3Q61011 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gnb3Q61011 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gnb3Q61011 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gnb3Q61011 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gnb3Q61011 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gnb3Q61011 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gnb3Q61011 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gnb3Q61011 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gnb3Q61011 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gnb3Q61011 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gnb3Q61011 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gnb3Q61011 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gnb3Q61011 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gnb3Q61011 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gnb3Q61011 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gnb3Q61011 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnb3Q61011 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnb3Q61011 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gnb3Q61011 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gnb3Q61011 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gnb3Q61011 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gnb3Q61011 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gnb3Q61011 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnb3Q61011 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnb3Q61011 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gnb3Q61011 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gnb3Q61011 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gnb3Q61011 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnb3Q61011 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gnb3Q61011 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gnb3Q61011 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnb3Q61011 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnb3Q61011 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnb3Q61011 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnb3Q61011 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnb3Q61011 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnb3Q61011 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnb3Q61011 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnb3Q61011 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnb3Q61011 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gnb3Q61011 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gnb3Q61011 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gnb3Q61011 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gnb3Q61011 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gnb3Q61011 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms