Protein–RNA interactions for Protein: Q60945

Mtcp1, Protein p13 MTCP-1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcp1Q60945 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Mtcp1Q60945 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mtcp1Q60945 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mtcp1Q60945 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mtcp1Q60945 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mtcp1Q60945 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mtcp1Q60945 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtcp1Q60945 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtcp1Q60945 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtcp1Q60945 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mtcp1Q60945 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mtcp1Q60945 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mtcp1Q60945 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtcp1Q60945 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Mtcp1Q60945 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtcp1Q60945 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mtcp1Q60945 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mtcp1Q60945 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mtcp1Q60945 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtcp1Q60945 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtcp1Q60945 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mtcp1Q60945 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mtcp1Q60945 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mtcp1Q60945 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mtcp1Q60945 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mtcp1Q60945 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Mtcp1Q60945 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mtcp1Q60945 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mtcp1Q60945 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mtcp1Q60945 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mtcp1Q60945 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mtcp1Q60945 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mtcp1Q60945 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mtcp1Q60945 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mtcp1Q60945 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mtcp1Q60945 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mtcp1Q60945 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mtcp1Q60945 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mtcp1Q60945 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mtcp1Q60945 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtcp1Q60945 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtcp1Q60945 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtcp1Q60945 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mtcp1Q60945 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mtcp1Q60945 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mtcp1Q60945 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mtcp1Q60945 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcp1Q60945 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mtcp1Q60945 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtcp1Q60945 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtcp1Q60945 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtcp1Q60945 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtcp1Q60945 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mtcp1Q60945 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mtcp1Q60945 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mtcp1Q60945 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mtcp1Q60945 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mtcp1Q60945 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mtcp1Q60945 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mtcp1Q60945 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtcp1Q60945 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mtcp1Q60945 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mtcp1Q60945 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtcp1Q60945 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtcp1Q60945 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtcp1Q60945 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mtcp1Q60945 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtcp1Q60945 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtcp1Q60945 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtcp1Q60945 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtcp1Q60945 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtcp1Q60945 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mtcp1Q60945 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mtcp1Q60945 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mtcp1Q60945 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mtcp1Q60945 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mtcp1Q60945 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcp1Q60945 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcp1Q60945 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtcp1Q60945 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcp1Q60945 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcp1Q60945 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcp1Q60945 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcp1Q60945 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtcp1Q60945 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcp1Q60945 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcp1Q60945 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcp1Q60945 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtcp1Q60945 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtcp1Q60945 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtcp1Q60945 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms