Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctf1Q60753 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctf1Q60753 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctf1Q60753 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctf1Q60753 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctf1Q60753 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctf1Q60753 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctf1Q60753 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctf1Q60753 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctf1Q60753 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctf1Q60753 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctf1Q60753 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctf1Q60753 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctf1Q60753 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctf1Q60753 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctf1Q60753 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctf1Q60753 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctf1Q60753 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctf1Q60753 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctf1Q60753 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctf1Q60753 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctf1Q60753 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctf1Q60753 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctf1Q60753 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctf1Q60753 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctf1Q60753 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctf1Q60753 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctf1Q60753 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctf1Q60753 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctf1Q60753 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctf1Q60753 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctf1Q60753 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctf1Q60753 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctf1Q60753 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctf1Q60753 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctf1Q60753 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctf1Q60753 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctf1Q60753 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctf1Q60753 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctf1Q60753 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctf1Q60753 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctf1Q60753 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctf1Q60753 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctf1Q60753 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctf1Q60753 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctf1Q60753 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctf1Q60753 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctf1Q60753 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctf1Q60753 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctf1Q60753 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctf1Q60753 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctf1Q60753 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctf1Q60753 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctf1Q60753 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctf1Q60753 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctf1Q60753 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctf1Q60753 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctf1Q60753 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctf1Q60753 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctf1Q60753 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctf1Q60753 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctf1Q60753 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctf1Q60753 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctf1Q60753 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctf1Q60753 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctf1Q60753 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctf1Q60753 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctf1Q60753 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctf1Q60753 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctf1Q60753 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctf1Q60753 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ctf1Q60753 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ctf1Q60753 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctf1Q60753 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctf1Q60753 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctf1Q60753 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctf1Q60753 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctf1Q60753 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctf1Q60753 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctf1Q60753 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctf1Q60753 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctf1Q60753 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctf1Q60753 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctf1Q60753 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctf1Q60753 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctf1Q60753 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctf1Q60753 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms