Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r195Q5SVD6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r195Q5SVD6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r195Q5SVD6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r195Q5SVD6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r195Q5SVD6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r195Q5SVD6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r195Q5SVD6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r195Q5SVD6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r195Q5SVD6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r195Q5SVD6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r195Q5SVD6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r195Q5SVD6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r195Q5SVD6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r195Q5SVD6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r195Q5SVD6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r195Q5SVD6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r195Q5SVD6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r195Q5SVD6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r195Q5SVD6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r195Q5SVD6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r195Q5SVD6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r195Q5SVD6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r195Q5SVD6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r195Q5SVD6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r195Q5SVD6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r195Q5SVD6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r195Q5SVD6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r195Q5SVD6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r195Q5SVD6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r195Q5SVD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r195Q5SVD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r195Q5SVD6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r195Q5SVD6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r195Q5SVD6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r195Q5SVD6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r195Q5SVD6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r195Q5SVD6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r195Q5SVD6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r195Q5SVD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r195Q5SVD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r195Q5SVD6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r195Q5SVD6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r195Q5SVD6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r195Q5SVD6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r195Q5SVD6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r195Q5SVD6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r195Q5SVD6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r195Q5SVD6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r195Q5SVD6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r195Q5SVD6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r195Q5SVD6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r195Q5SVD6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms