Protein–RNA interactions for Protein: Q5RI75

Rasef, Ras and EF-hand domain-containing protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RasefQ5RI75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RasefQ5RI75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
RasefQ5RI75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RasefQ5RI75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RasefQ5RI75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RasefQ5RI75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RasefQ5RI75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RasefQ5RI75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RasefQ5RI75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RasefQ5RI75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RasefQ5RI75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RasefQ5RI75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RasefQ5RI75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RasefQ5RI75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RasefQ5RI75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RasefQ5RI75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RasefQ5RI75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RasefQ5RI75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RasefQ5RI75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RasefQ5RI75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RasefQ5RI75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RasefQ5RI75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RasefQ5RI75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RasefQ5RI75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RasefQ5RI75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RasefQ5RI75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RasefQ5RI75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RasefQ5RI75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RasefQ5RI75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RasefQ5RI75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RasefQ5RI75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RasefQ5RI75 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RasefQ5RI75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RasefQ5RI75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RasefQ5RI75 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RasefQ5RI75 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RasefQ5RI75 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RasefQ5RI75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RasefQ5RI75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RasefQ5RI75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RasefQ5RI75 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RasefQ5RI75 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RasefQ5RI75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RasefQ5RI75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RasefQ5RI75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RasefQ5RI75 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RasefQ5RI75 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RasefQ5RI75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RasefQ5RI75 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RasefQ5RI75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RasefQ5RI75 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RasefQ5RI75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RasefQ5RI75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RasefQ5RI75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RasefQ5RI75 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RasefQ5RI75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RasefQ5RI75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RasefQ5RI75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RasefQ5RI75 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RasefQ5RI75 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RasefQ5RI75 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RasefQ5RI75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RasefQ5RI75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RasefQ5RI75 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RasefQ5RI75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RasefQ5RI75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RasefQ5RI75 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RasefQ5RI75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RasefQ5RI75 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RasefQ5RI75 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RasefQ5RI75 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RasefQ5RI75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RasefQ5RI75 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RasefQ5RI75 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RasefQ5RI75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RasefQ5RI75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RasefQ5RI75 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RasefQ5RI75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RasefQ5RI75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RasefQ5RI75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RasefQ5RI75 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RasefQ5RI75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RasefQ5RI75 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RasefQ5RI75 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RasefQ5RI75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RasefQ5RI75 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RasefQ5RI75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RasefQ5RI75 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RasefQ5RI75 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RasefQ5RI75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RasefQ5RI75 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RasefQ5RI75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RasefQ5RI75 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RasefQ5RI75 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RasefQ5RI75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RasefQ5RI75 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RasefQ5RI75 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RasefQ5RI75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RasefQ5RI75 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RasefQ5RI75 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms