Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Prkaa1Q5EG47 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Prkaa1Q5EG47 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prkaa1Q5EG47 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prkaa1Q5EG47 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prkaa1Q5EG47 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Prkaa1Q5EG47 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Prkaa1Q5EG47 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prkaa1Q5EG47 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Prkaa1Q5EG47 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Prkaa1Q5EG47 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Prkaa1Q5EG47 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Prkaa1Q5EG47 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prkaa1Q5EG47 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Prkaa1Q5EG47 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Prkaa1Q5EG47 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prkaa1Q5EG47 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prkaa1Q5EG47 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Prkaa1Q5EG47 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Prkaa1Q5EG47 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Prkaa1Q5EG47 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Prkaa1Q5EG47 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prkaa1Q5EG47 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prkaa1Q5EG47 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prkaa1Q5EG47 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prkaa1Q5EG47 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prkaa1Q5EG47 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Prkaa1Q5EG47 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prkaa1Q5EG47 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prkaa1Q5EG47 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Prkaa1Q5EG47 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Prkaa1Q5EG47 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Prkaa1Q5EG47 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Prkaa1Q5EG47 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prkaa1Q5EG47 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prkaa1Q5EG47 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prkaa1Q5EG47 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prkaa1Q5EG47 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prkaa1Q5EG47 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prkaa1Q5EG47 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prkaa1Q5EG47 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Prkaa1Q5EG47 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prkaa1Q5EG47 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prkaa1Q5EG47 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prkaa1Q5EG47 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prkaa1Q5EG47 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prkaa1Q5EG47 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Prkaa1Q5EG47 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkaa1Q5EG47 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkaa1Q5EG47 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkaa1Q5EG47 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkaa1Q5EG47 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkaa1Q5EG47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkaa1Q5EG47 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkaa1Q5EG47 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prkaa1Q5EG47 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkaa1Q5EG47 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prkaa1Q5EG47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkaa1Q5EG47 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkaa1Q5EG47 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkaa1Q5EG47 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prkaa1Q5EG47 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prkaa1Q5EG47 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prkaa1Q5EG47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prkaa1Q5EG47 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prkaa1Q5EG47 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prkaa1Q5EG47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkaa1Q5EG47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prkaa1Q5EG47 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prkaa1Q5EG47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prkaa1Q5EG47 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prkaa1Q5EG47 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkaa1Q5EG47 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Prkaa1Q5EG47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkaa1Q5EG47 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkaa1Q5EG47 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkaa1Q5EG47 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkaa1Q5EG47 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkaa1Q5EG47 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkaa1Q5EG47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkaa1Q5EG47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkaa1Q5EG47 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkaa1Q5EG47 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkaa1Q5EG47 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkaa1Q5EG47 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkaa1Q5EG47 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkaa1Q5EG47 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkaa1Q5EG47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkaa1Q5EG47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkaa1Q5EG47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkaa1Q5EG47 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkaa1Q5EG47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkaa1Q5EG47 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkaa1Q5EG47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkaa1Q5EG47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms