Protein–RNA interactions for Protein: Q571G4

Lin54, Protein lin-54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin54Q571G4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lin54Q571G4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Lin54Q571G4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lin54Q571G4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lin54Q571G4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lin54Q571G4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lin54Q571G4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lin54Q571G4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lin54Q571G4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lin54Q571G4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lin54Q571G4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lin54Q571G4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lin54Q571G4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lin54Q571G4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lin54Q571G4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lin54Q571G4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lin54Q571G4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lin54Q571G4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lin54Q571G4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lin54Q571G4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lin54Q571G4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lin54Q571G4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lin54Q571G4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lin54Q571G4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lin54Q571G4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lin54Q571G4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lin54Q571G4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lin54Q571G4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lin54Q571G4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lin54Q571G4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lin54Q571G4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lin54Q571G4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lin54Q571G4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lin54Q571G4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin54Q571G4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lin54Q571G4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin54Q571G4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lin54Q571G4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lin54Q571G4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin54Q571G4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin54Q571G4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin54Q571G4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lin54Q571G4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lin54Q571G4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lin54Q571G4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lin54Q571G4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lin54Q571G4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lin54Q571G4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lin54Q571G4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lin54Q571G4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lin54Q571G4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lin54Q571G4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lin54Q571G4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lin54Q571G4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lin54Q571G4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lin54Q571G4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lin54Q571G4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lin54Q571G4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin54Q571G4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin54Q571G4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin54Q571G4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin54Q571G4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin54Q571G4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lin54Q571G4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin54Q571G4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin54Q571G4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin54Q571G4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin54Q571G4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lin54Q571G4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin54Q571G4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin54Q571G4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin54Q571G4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin54Q571G4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin54Q571G4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lin54Q571G4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lin54Q571G4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin54Q571G4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lin54Q571G4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lin54Q571G4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lin54Q571G4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lin54Q571G4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lin54Q571G4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lin54Q571G4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Lin54Q571G4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lin54Q571G4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lin54Q571G4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lin54Q571G4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lin54Q571G4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lin54Q571G4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lin54Q571G4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lin54Q571G4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lin54Q571G4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lin54Q571G4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin54Q571G4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin54Q571G4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin54Q571G4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin54Q571G4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin54Q571G4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin54Q571G4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin54Q571G4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms