Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Scn2bQ56A07 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Scn2bQ56A07 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Scn2bQ56A07 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Scn2bQ56A07 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Scn2bQ56A07 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Scn2bQ56A07 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Scn2bQ56A07 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Scn2bQ56A07 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Scn2bQ56A07 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Scn2bQ56A07 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Scn2bQ56A07 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scn2bQ56A07 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Scn2bQ56A07 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn2bQ56A07 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Scn2bQ56A07 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn2bQ56A07 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn2bQ56A07 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn2bQ56A07 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scn2bQ56A07 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Scn2bQ56A07 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scn2bQ56A07 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scn2bQ56A07 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Scn2bQ56A07 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Scn2bQ56A07 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scn2bQ56A07 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn2bQ56A07 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn2bQ56A07 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn2bQ56A07 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn2bQ56A07 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn2bQ56A07 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn2bQ56A07 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn2bQ56A07 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn2bQ56A07 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Scn2bQ56A07 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Scn2bQ56A07 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Scn2bQ56A07 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scn2bQ56A07 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scn2bQ56A07 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scn2bQ56A07 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scn2bQ56A07 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn2bQ56A07 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Scn2bQ56A07 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn2bQ56A07 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scn2bQ56A07 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn2bQ56A07 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn2bQ56A07 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn2bQ56A07 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn2bQ56A07 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn2bQ56A07 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn2bQ56A07 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn2bQ56A07 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn2bQ56A07 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn2bQ56A07 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scn2bQ56A07 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn2bQ56A07 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scn2bQ56A07 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scn2bQ56A07 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scn2bQ56A07 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Scn2bQ56A07 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scn2bQ56A07 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scn2bQ56A07 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Scn2bQ56A07 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scn2bQ56A07 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn2bQ56A07 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn2bQ56A07 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn2bQ56A07 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn2bQ56A07 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn2bQ56A07 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn2bQ56A07 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn2bQ56A07 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn2bQ56A07 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scn2bQ56A07 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn2bQ56A07 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn2bQ56A07 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn2bQ56A07 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn2bQ56A07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn2bQ56A07 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn2bQ56A07 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn2bQ56A07 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn2bQ56A07 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn2bQ56A07 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn2bQ56A07 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn2bQ56A07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scn2bQ56A07 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn2bQ56A07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scn2bQ56A07 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn2bQ56A07 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn2bQ56A07 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn2bQ56A07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn2bQ56A07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn2bQ56A07 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scn2bQ56A07 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn2bQ56A07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn2bQ56A07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms