Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Otol1Q4ZJM7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Otol1Q4ZJM7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Otol1Q4ZJM7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Otol1Q4ZJM7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Otol1Q4ZJM7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Otol1Q4ZJM7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Otol1Q4ZJM7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Otol1Q4ZJM7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Otol1Q4ZJM7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Otol1Q4ZJM7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Otol1Q4ZJM7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Otol1Q4ZJM7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Otol1Q4ZJM7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Otol1Q4ZJM7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Otol1Q4ZJM7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Otol1Q4ZJM7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Otol1Q4ZJM7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Otol1Q4ZJM7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Otol1Q4ZJM7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Otol1Q4ZJM7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Otol1Q4ZJM7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Otol1Q4ZJM7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Otol1Q4ZJM7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Otol1Q4ZJM7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Otol1Q4ZJM7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Otol1Q4ZJM7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Otol1Q4ZJM7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Otol1Q4ZJM7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Otol1Q4ZJM7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Otol1Q4ZJM7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Otol1Q4ZJM7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Otol1Q4ZJM7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Otol1Q4ZJM7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Otol1Q4ZJM7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Otol1Q4ZJM7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Otol1Q4ZJM7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Otol1Q4ZJM7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Otol1Q4ZJM7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Otol1Q4ZJM7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Otol1Q4ZJM7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Otol1Q4ZJM7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Otol1Q4ZJM7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Otol1Q4ZJM7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Otol1Q4ZJM7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Otol1Q4ZJM7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Otol1Q4ZJM7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Otol1Q4ZJM7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Otol1Q4ZJM7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Otol1Q4ZJM7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Otol1Q4ZJM7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Otol1Q4ZJM7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otol1Q4ZJM7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Otol1Q4ZJM7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Otol1Q4ZJM7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Otol1Q4ZJM7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Otol1Q4ZJM7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Otol1Q4ZJM7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Otol1Q4ZJM7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Otol1Q4ZJM7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Otol1Q4ZJM7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Otol1Q4ZJM7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Otol1Q4ZJM7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Otol1Q4ZJM7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Otol1Q4ZJM7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Otol1Q4ZJM7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Otol1Q4ZJM7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Otol1Q4ZJM7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Otol1Q4ZJM7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Otol1Q4ZJM7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Otol1Q4ZJM7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Otol1Q4ZJM7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Otol1Q4ZJM7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Otol1Q4ZJM7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Otol1Q4ZJM7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Otol1Q4ZJM7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Otol1Q4ZJM7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Otol1Q4ZJM7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Otol1Q4ZJM7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Otol1Q4ZJM7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Otol1Q4ZJM7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Otol1Q4ZJM7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Otol1Q4ZJM7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Otol1Q4ZJM7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Otol1Q4ZJM7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Otol1Q4ZJM7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Otol1Q4ZJM7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Otol1Q4ZJM7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Otol1Q4ZJM7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Otol1Q4ZJM7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Otol1Q4ZJM7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Otol1Q4ZJM7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Otol1Q4ZJM7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Otol1Q4ZJM7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms