Protein–RNA interactions for Protein: Q3V4B5

Commd6, COMM domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd6Q3V4B5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Commd6Q3V4B5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Commd6Q3V4B5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Commd6Q3V4B5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Commd6Q3V4B5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Commd6Q3V4B5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Commd6Q3V4B5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Commd6Q3V4B5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Commd6Q3V4B5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Commd6Q3V4B5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Commd6Q3V4B5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Commd6Q3V4B5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Commd6Q3V4B5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Commd6Q3V4B5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Commd6Q3V4B5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Commd6Q3V4B5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Commd6Q3V4B5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Commd6Q3V4B5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Commd6Q3V4B5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Commd6Q3V4B5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Commd6Q3V4B5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Commd6Q3V4B5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Commd6Q3V4B5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Commd6Q3V4B5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Commd6Q3V4B5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Commd6Q3V4B5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Commd6Q3V4B5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Commd6Q3V4B5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Commd6Q3V4B5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Commd6Q3V4B5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Commd6Q3V4B5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Commd6Q3V4B5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Commd6Q3V4B5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Commd6Q3V4B5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Commd6Q3V4B5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Commd6Q3V4B5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Commd6Q3V4B5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Commd6Q3V4B5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Commd6Q3V4B5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Commd6Q3V4B5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Commd6Q3V4B5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Commd6Q3V4B5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Commd6Q3V4B5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Commd6Q3V4B5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Commd6Q3V4B5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Commd6Q3V4B5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Commd6Q3V4B5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Commd6Q3V4B5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Commd6Q3V4B5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Commd6Q3V4B5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Commd6Q3V4B5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Commd6Q3V4B5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Commd6Q3V4B5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Commd6Q3V4B5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Commd6Q3V4B5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Commd6Q3V4B5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Commd6Q3V4B5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Commd6Q3V4B5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Commd6Q3V4B5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Commd6Q3V4B5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Commd6Q3V4B5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Commd6Q3V4B5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Commd6Q3V4B5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Commd6Q3V4B5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Commd6Q3V4B5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Commd6Q3V4B5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Commd6Q3V4B5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Commd6Q3V4B5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Commd6Q3V4B5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Commd6Q3V4B5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Commd6Q3V4B5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Commd6Q3V4B5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Commd6Q3V4B5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Commd6Q3V4B5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Commd6Q3V4B5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Commd6Q3V4B5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Commd6Q3V4B5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Commd6Q3V4B5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Commd6Q3V4B5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Commd6Q3V4B5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Commd6Q3V4B5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Commd6Q3V4B5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Commd6Q3V4B5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Commd6Q3V4B5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Commd6Q3V4B5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Commd6Q3V4B5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Commd6Q3V4B5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Commd6Q3V4B5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Commd6Q3V4B5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Commd6Q3V4B5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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