Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BC030870Q3V2G4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
BC030870Q3V2G4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC030870Q3V2G4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BC030870Q3V2G4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
BC030870Q3V2G4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BC030870Q3V2G4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BC030870Q3V2G4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BC030870Q3V2G4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BC030870Q3V2G4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BC030870Q3V2G4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC030870Q3V2G4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC030870Q3V2G4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC030870Q3V2G4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BC030870Q3V2G4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BC030870Q3V2G4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BC030870Q3V2G4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BC030870Q3V2G4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC030870Q3V2G4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC030870Q3V2G4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BC030870Q3V2G4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BC030870Q3V2G4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC030870Q3V2G4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC030870Q3V2G4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BC030870Q3V2G4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BC030870Q3V2G4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BC030870Q3V2G4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BC030870Q3V2G4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BC030870Q3V2G4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BC030870Q3V2G4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC030870Q3V2G4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC030870Q3V2G4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BC030870Q3V2G4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC030870Q3V2G4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC030870Q3V2G4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC030870Q3V2G4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BC030870Q3V2G4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BC030870Q3V2G4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BC030870Q3V2G4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BC030870Q3V2G4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BC030870Q3V2G4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BC030870Q3V2G4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BC030870Q3V2G4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BC030870Q3V2G4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BC030870Q3V2G4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BC030870Q3V2G4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BC030870Q3V2G4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BC030870Q3V2G4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC030870Q3V2G4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC030870Q3V2G4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BC030870Q3V2G4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC030870Q3V2G4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BC030870Q3V2G4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BC030870Q3V2G4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC030870Q3V2G4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC030870Q3V2G4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC030870Q3V2G4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC030870Q3V2G4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC030870Q3V2G4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BC030870Q3V2G4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC030870Q3V2G4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BC030870Q3V2G4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BC030870Q3V2G4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BC030870Q3V2G4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BC030870Q3V2G4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BC030870Q3V2G4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BC030870Q3V2G4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC030870Q3V2G4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC030870Q3V2G4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC030870Q3V2G4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BC030870Q3V2G4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BC030870Q3V2G4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BC030870Q3V2G4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC030870Q3V2G4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BC030870Q3V2G4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC030870Q3V2G4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC030870Q3V2G4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC030870Q3V2G4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC030870Q3V2G4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC030870Q3V2G4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC030870Q3V2G4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC030870Q3V2G4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC030870Q3V2G4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC030870Q3V2G4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BC030870Q3V2G4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC030870Q3V2G4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC030870Q3V2G4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC030870Q3V2G4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC030870Q3V2G4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC030870Q3V2G4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC030870Q3V2G4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC030870Q3V2G4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC030870Q3V2G4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BC030870Q3V2G4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC030870Q3V2G4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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