Protein–RNA interactions for Protein: Q3U564

Dcp1b, mRNA-decapping enzyme 1B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcp1bQ3U564 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Dcp1bQ3U564 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Dcp1bQ3U564 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Dcp1bQ3U564 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Dcp1bQ3U564 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Dcp1bQ3U564 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dcp1bQ3U564 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Dcp1bQ3U564 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Dcp1bQ3U564 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dcp1bQ3U564 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dcp1bQ3U564 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Dcp1bQ3U564 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dcp1bQ3U564 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcp1bQ3U564 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dcp1bQ3U564 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcp1bQ3U564 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcp1bQ3U564 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcp1bQ3U564 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcp1bQ3U564 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dcp1bQ3U564 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcp1bQ3U564 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dcp1bQ3U564 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dcp1bQ3U564 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dcp1bQ3U564 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dcp1bQ3U564 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dcp1bQ3U564 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dcp1bQ3U564 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dcp1bQ3U564 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcp1bQ3U564 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Dcp1bQ3U564 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dcp1bQ3U564 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dcp1bQ3U564 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dcp1bQ3U564 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dcp1bQ3U564 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dcp1bQ3U564 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dcp1bQ3U564 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dcp1bQ3U564 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dcp1bQ3U564 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dcp1bQ3U564 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dcp1bQ3U564 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dcp1bQ3U564 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dcp1bQ3U564 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcp1bQ3U564 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcp1bQ3U564 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcp1bQ3U564 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcp1bQ3U564 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcp1bQ3U564 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcp1bQ3U564 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcp1bQ3U564 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dcp1bQ3U564 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dcp1bQ3U564 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcp1bQ3U564 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dcp1bQ3U564 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dcp1bQ3U564 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dcp1bQ3U564 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dcp1bQ3U564 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dcp1bQ3U564 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dcp1bQ3U564 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Dcp1bQ3U564 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dcp1bQ3U564 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Dcp1bQ3U564 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dcp1bQ3U564 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dcp1bQ3U564 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dcp1bQ3U564 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dcp1bQ3U564 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dcp1bQ3U564 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dcp1bQ3U564 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dcp1bQ3U564 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dcp1bQ3U564 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dcp1bQ3U564 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dcp1bQ3U564 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dcp1bQ3U564 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dcp1bQ3U564 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dcp1bQ3U564 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dcp1bQ3U564 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dcp1bQ3U564 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dcp1bQ3U564 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dcp1bQ3U564 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dcp1bQ3U564 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dcp1bQ3U564 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dcp1bQ3U564 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dcp1bQ3U564 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dcp1bQ3U564 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dcp1bQ3U564 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dcp1bQ3U564 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dcp1bQ3U564 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dcp1bQ3U564 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dcp1bQ3U564 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dcp1bQ3U564 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dcp1bQ3U564 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dcp1bQ3U564 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dcp1bQ3U564 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dcp1bQ3U564 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dcp1bQ3U564 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dcp1bQ3U564 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dcp1bQ3U564 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcp1bQ3U564 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcp1bQ3U564 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dcp1bQ3U564 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dcp1bQ3U564 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms