Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ctu2Q3U308 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ctu2Q3U308 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ctu2Q3U308 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ctu2Q3U308 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ctu2Q3U308 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ctu2Q3U308 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ctu2Q3U308 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ctu2Q3U308 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ctu2Q3U308 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ctu2Q3U308 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ctu2Q3U308 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctu2Q3U308 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctu2Q3U308 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctu2Q3U308 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Ctu2Q3U308 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctu2Q3U308 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctu2Q3U308 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctu2Q3U308 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctu2Q3U308 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctu2Q3U308 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctu2Q3U308 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctu2Q3U308 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctu2Q3U308 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctu2Q3U308 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctu2Q3U308 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctu2Q3U308 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctu2Q3U308 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ctu2Q3U308 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctu2Q3U308 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctu2Q3U308 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctu2Q3U308 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctu2Q3U308 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ctu2Q3U308 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ctu2Q3U308 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ctu2Q3U308 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctu2Q3U308 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ctu2Q3U308 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctu2Q3U308 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ctu2Q3U308 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ctu2Q3U308 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ctu2Q3U308 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ctu2Q3U308 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctu2Q3U308 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctu2Q3U308 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctu2Q3U308 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctu2Q3U308 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctu2Q3U308 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctu2Q3U308 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctu2Q3U308 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctu2Q3U308 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctu2Q3U308 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctu2Q3U308 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctu2Q3U308 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctu2Q3U308 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctu2Q3U308 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctu2Q3U308 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctu2Q3U308 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctu2Q3U308 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctu2Q3U308 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctu2Q3U308 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctu2Q3U308 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctu2Q3U308 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctu2Q3U308 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctu2Q3U308 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctu2Q3U308 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctu2Q3U308 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctu2Q3U308 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctu2Q3U308 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctu2Q3U308 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctu2Q3U308 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctu2Q3U308 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctu2Q3U308 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctu2Q3U308 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctu2Q3U308 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctu2Q3U308 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctu2Q3U308 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctu2Q3U308 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctu2Q3U308 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctu2Q3U308 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctu2Q3U308 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctu2Q3U308 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctu2Q3U308 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctu2Q3U308 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctu2Q3U308 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctu2Q3U308 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctu2Q3U308 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctu2Q3U308 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctu2Q3U308 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctu2Q3U308 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ctu2Q3U308 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctu2Q3U308 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctu2Q3U308 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctu2Q3U308 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctu2Q3U308 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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