Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTA7

Cblb, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblbQ3TTA7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CblbQ3TTA7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CblbQ3TTA7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CblbQ3TTA7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CblbQ3TTA7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CblbQ3TTA7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CblbQ3TTA7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CblbQ3TTA7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CblbQ3TTA7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CblbQ3TTA7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CblbQ3TTA7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CblbQ3TTA7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CblbQ3TTA7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CblbQ3TTA7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CblbQ3TTA7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CblbQ3TTA7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CblbQ3TTA7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CblbQ3TTA7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CblbQ3TTA7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CblbQ3TTA7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CblbQ3TTA7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CblbQ3TTA7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CblbQ3TTA7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CblbQ3TTA7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CblbQ3TTA7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CblbQ3TTA7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CblbQ3TTA7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CblbQ3TTA7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CblbQ3TTA7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CblbQ3TTA7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CblbQ3TTA7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CblbQ3TTA7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CblbQ3TTA7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CblbQ3TTA7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CblbQ3TTA7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CblbQ3TTA7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CblbQ3TTA7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CblbQ3TTA7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CblbQ3TTA7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CblbQ3TTA7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CblbQ3TTA7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CblbQ3TTA7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CblbQ3TTA7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CblbQ3TTA7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CblbQ3TTA7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CblbQ3TTA7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CblbQ3TTA7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CblbQ3TTA7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CblbQ3TTA7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CblbQ3TTA7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CblbQ3TTA7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CblbQ3TTA7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CblbQ3TTA7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CblbQ3TTA7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CblbQ3TTA7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CblbQ3TTA7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CblbQ3TTA7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CblbQ3TTA7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CblbQ3TTA7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CblbQ3TTA7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CblbQ3TTA7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CblbQ3TTA7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CblbQ3TTA7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CblbQ3TTA7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CblbQ3TTA7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CblbQ3TTA7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CblbQ3TTA7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CblbQ3TTA7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CblbQ3TTA7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CblbQ3TTA7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CblbQ3TTA7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CblbQ3TTA7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CblbQ3TTA7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CblbQ3TTA7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CblbQ3TTA7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CblbQ3TTA7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CblbQ3TTA7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CblbQ3TTA7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CblbQ3TTA7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CblbQ3TTA7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CblbQ3TTA7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CblbQ3TTA7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CblbQ3TTA7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CblbQ3TTA7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CblbQ3TTA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CblbQ3TTA7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CblbQ3TTA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CblbQ3TTA7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CblbQ3TTA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CblbQ3TTA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CblbQ3TTA7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CblbQ3TTA7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CblbQ3TTA7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CblbQ3TTA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CblbQ3TTA7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CblbQ3TTA7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CblbQ3TTA7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CblbQ3TTA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CblbQ3TTA7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CblbQ3TTA7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms