Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc4Q3TR08 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc4Q3TR08 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc4Q3TR08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc4Q3TR08 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc4Q3TR08 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc4Q3TR08 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc4Q3TR08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc4Q3TR08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc4Q3TR08 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc4Q3TR08 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc4Q3TR08 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc4Q3TR08 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc4Q3TR08 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc4Q3TR08 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc4Q3TR08 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc4Q3TR08 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc4Q3TR08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc4Q3TR08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc4Q3TR08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc4Q3TR08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc4Q3TR08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc4Q3TR08 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc4Q3TR08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc4Q3TR08 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc4Q3TR08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc4Q3TR08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc4Q3TR08 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc4Q3TR08 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc4Q3TR08 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc4Q3TR08 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc4Q3TR08 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc4Q3TR08 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc4Q3TR08 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc4Q3TR08 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc4Q3TR08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc4Q3TR08 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fndc4Q3TR08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fndc4Q3TR08 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc4Q3TR08 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc4Q3TR08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc4Q3TR08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc4Q3TR08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc4Q3TR08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc4Q3TR08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc4Q3TR08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc4Q3TR08 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc4Q3TR08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc4Q3TR08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc4Q3TR08 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc4Q3TR08 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc4Q3TR08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc4Q3TR08 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc4Q3TR08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc4Q3TR08 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc4Q3TR08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fndc4Q3TR08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc4Q3TR08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc4Q3TR08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc4Q3TR08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc4Q3TR08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc4Q3TR08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc4Q3TR08 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc4Q3TR08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc4Q3TR08 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc4Q3TR08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc4Q3TR08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc4Q3TR08 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc4Q3TR08 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc4Q3TR08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc4Q3TR08 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc4Q3TR08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc4Q3TR08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc4Q3TR08 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc4Q3TR08 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc4Q3TR08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc4Q3TR08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc4Q3TR08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc4Q3TR08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc4Q3TR08 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc4Q3TR08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc4Q3TR08 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc4Q3TR08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc4Q3TR08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc4Q3TR08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc4Q3TR08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc4Q3TR08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc4Q3TR08 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc4Q3TR08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc4Q3TR08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc4Q3TR08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc4Q3TR08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc4Q3TR08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc4Q3TR08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc4Q3TR08 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fndc4Q3TR08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fndc4Q3TR08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc4Q3TR08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc4Q3TR08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fndc4Q3TR08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms