Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJB1

Zmym1, Zinc finger, MYM domain containing 1, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmym1Q3TJB1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Zmym1Q3TJB1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Zmym1Q3TJB1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Zmym1Q3TJB1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Zmym1Q3TJB1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Zmym1Q3TJB1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Zmym1Q3TJB1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Zmym1Q3TJB1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Zmym1Q3TJB1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Zmym1Q3TJB1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Zmym1Q3TJB1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Zmym1Q3TJB1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Zmym1Q3TJB1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Zmym1Q3TJB1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Zmym1Q3TJB1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Zmym1Q3TJB1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Zmym1Q3TJB1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Zmym1Q3TJB1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Zmym1Q3TJB1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Zmym1Q3TJB1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Zmym1Q3TJB1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Zmym1Q3TJB1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Zmym1Q3TJB1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Zmym1Q3TJB1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Zmym1Q3TJB1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Zmym1Q3TJB1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Zmym1Q3TJB1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Zmym1Q3TJB1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Zmym1Q3TJB1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Zmym1Q3TJB1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Zmym1Q3TJB1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Zmym1Q3TJB1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Zmym1Q3TJB1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Zmym1Q3TJB1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Zmym1Q3TJB1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Zmym1Q3TJB1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Zmym1Q3TJB1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Zmym1Q3TJB1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Zmym1Q3TJB1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Zmym1Q3TJB1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Zmym1Q3TJB1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Zmym1Q3TJB1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Zmym1Q3TJB1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Zmym1Q3TJB1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Zmym1Q3TJB1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Zmym1Q3TJB1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmym1Q3TJB1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Zmym1Q3TJB1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Zmym1Q3TJB1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Zmym1Q3TJB1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Zmym1Q3TJB1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Zmym1Q3TJB1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zmym1Q3TJB1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Zmym1Q3TJB1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Zmym1Q3TJB1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zmym1Q3TJB1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Zmym1Q3TJB1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Zmym1Q3TJB1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Zmym1Q3TJB1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Zmym1Q3TJB1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zmym1Q3TJB1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Zmym1Q3TJB1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Zmym1Q3TJB1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zmym1Q3TJB1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zmym1Q3TJB1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zmym1Q3TJB1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Zmym1Q3TJB1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zmym1Q3TJB1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zmym1Q3TJB1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Zmym1Q3TJB1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zmym1Q3TJB1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zmym1Q3TJB1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Zmym1Q3TJB1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zmym1Q3TJB1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zmym1Q3TJB1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zmym1Q3TJB1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zmym1Q3TJB1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zmym1Q3TJB1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zmym1Q3TJB1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zmym1Q3TJB1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zmym1Q3TJB1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zmym1Q3TJB1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Zmym1Q3TJB1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zmym1Q3TJB1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zmym1Q3TJB1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zmym1Q3TJB1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zmym1Q3TJB1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zmym1Q3TJB1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zmym1Q3TJB1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zmym1Q3TJB1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zmym1Q3TJB1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zmym1Q3TJB1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zmym1Q3TJB1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zmym1Q3TJB1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zmym1Q3TJB1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zmym1Q3TJB1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zmym1Q3TJB1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zmym1Q3TJB1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zmym1Q3TJB1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zmym1Q3TJB1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms