Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Cul4aQ3TCH7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cul4aQ3TCH7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cul4aQ3TCH7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul4aQ3TCH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cul4aQ3TCH7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul4aQ3TCH7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cul4aQ3TCH7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cul4aQ3TCH7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul4aQ3TCH7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul4aQ3TCH7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cul4aQ3TCH7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul4aQ3TCH7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul4aQ3TCH7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cul4aQ3TCH7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul4aQ3TCH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cul4aQ3TCH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cul4aQ3TCH7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cul4aQ3TCH7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cul4aQ3TCH7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul4aQ3TCH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cul4aQ3TCH7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cul4aQ3TCH7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cul4aQ3TCH7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cul4aQ3TCH7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cul4aQ3TCH7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Cul4aQ3TCH7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cul4aQ3TCH7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cul4aQ3TCH7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cul4aQ3TCH7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cul4aQ3TCH7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cul4aQ3TCH7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cul4aQ3TCH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cul4aQ3TCH7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cul4aQ3TCH7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cul4aQ3TCH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cul4aQ3TCH7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul4aQ3TCH7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul4aQ3TCH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cul4aQ3TCH7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul4aQ3TCH7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul4aQ3TCH7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul4aQ3TCH7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cul4aQ3TCH7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cul4aQ3TCH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cul4aQ3TCH7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cul4aQ3TCH7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cul4aQ3TCH7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cul4aQ3TCH7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Cul4aQ3TCH7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cul4aQ3TCH7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cul4aQ3TCH7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cul4aQ3TCH7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cul4aQ3TCH7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul4aQ3TCH7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul4aQ3TCH7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cul4aQ3TCH7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul4aQ3TCH7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul4aQ3TCH7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul4aQ3TCH7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cul4aQ3TCH7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul4aQ3TCH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul4aQ3TCH7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul4aQ3TCH7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cul4aQ3TCH7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cul4aQ3TCH7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cul4aQ3TCH7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cul4aQ3TCH7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cul4aQ3TCH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cul4aQ3TCH7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cul4aQ3TCH7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cul4aQ3TCH7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cul4aQ3TCH7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cul4aQ3TCH7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul4aQ3TCH7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul4aQ3TCH7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul4aQ3TCH7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul4aQ3TCH7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul4aQ3TCH7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul4aQ3TCH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul4aQ3TCH7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul4aQ3TCH7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul4aQ3TCH7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul4aQ3TCH7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul4aQ3TCH7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul4aQ3TCH7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul4aQ3TCH7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul4aQ3TCH7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul4aQ3TCH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul4aQ3TCH7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul4aQ3TCH7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul4aQ3TCH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul4aQ3TCH7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
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