Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAE8

Alg6, Dolichyl pyrophosphate Man9GlcNAc2 alpha-1,3-glucosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg6Q3TAE8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Alg6Q3TAE8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Alg6Q3TAE8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Alg6Q3TAE8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Alg6Q3TAE8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Alg6Q3TAE8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Alg6Q3TAE8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Alg6Q3TAE8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alg6Q3TAE8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Alg6Q3TAE8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Alg6Q3TAE8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Alg6Q3TAE8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Alg6Q3TAE8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alg6Q3TAE8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Alg6Q3TAE8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alg6Q3TAE8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Alg6Q3TAE8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Alg6Q3TAE8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Alg6Q3TAE8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Alg6Q3TAE8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Alg6Q3TAE8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Alg6Q3TAE8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Alg6Q3TAE8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Alg6Q3TAE8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Alg6Q3TAE8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alg6Q3TAE8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Alg6Q3TAE8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Alg6Q3TAE8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Alg6Q3TAE8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Alg6Q3TAE8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alg6Q3TAE8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Alg6Q3TAE8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Alg6Q3TAE8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Alg6Q3TAE8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alg6Q3TAE8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Alg6Q3TAE8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alg6Q3TAE8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alg6Q3TAE8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alg6Q3TAE8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alg6Q3TAE8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Alg6Q3TAE8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alg6Q3TAE8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Alg6Q3TAE8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Alg6Q3TAE8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alg6Q3TAE8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alg6Q3TAE8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Alg6Q3TAE8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Alg6Q3TAE8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Alg6Q3TAE8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Alg6Q3TAE8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Alg6Q3TAE8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alg6Q3TAE8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Alg6Q3TAE8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Alg6Q3TAE8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alg6Q3TAE8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alg6Q3TAE8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alg6Q3TAE8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Alg6Q3TAE8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alg6Q3TAE8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Alg6Q3TAE8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Alg6Q3TAE8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Alg6Q3TAE8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Alg6Q3TAE8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Alg6Q3TAE8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Alg6Q3TAE8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Alg6Q3TAE8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alg6Q3TAE8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Alg6Q3TAE8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Alg6Q3TAE8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg6Q3TAE8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Alg6Q3TAE8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alg6Q3TAE8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg6Q3TAE8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg6Q3TAE8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Alg6Q3TAE8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Alg6Q3TAE8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alg6Q3TAE8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Alg6Q3TAE8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alg6Q3TAE8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg6Q3TAE8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Alg6Q3TAE8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Alg6Q3TAE8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alg6Q3TAE8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Alg6Q3TAE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alg6Q3TAE8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg6Q3TAE8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alg6Q3TAE8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg6Q3TAE8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alg6Q3TAE8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alg6Q3TAE8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Alg6Q3TAE8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Alg6Q3TAE8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Alg6Q3TAE8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alg6Q3TAE8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alg6Q3TAE8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alg6Q3TAE8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg6Q3TAE8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Alg6Q3TAE8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Alg6Q3TAE8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Alg6Q3TAE8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms