Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HelqQ2VPA6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36■■■■□ 3.35
HelqQ2VPA6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HelqQ2VPA6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HelqQ2VPA6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
HelqQ2VPA6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HelqQ2VPA6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HelqQ2VPA6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HelqQ2VPA6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HelqQ2VPA6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HelqQ2VPA6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HelqQ2VPA6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HelqQ2VPA6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HelqQ2VPA6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HelqQ2VPA6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HelqQ2VPA6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HelqQ2VPA6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
HelqQ2VPA6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HelqQ2VPA6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
HelqQ2VPA6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HelqQ2VPA6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HelqQ2VPA6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HelqQ2VPA6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HelqQ2VPA6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HelqQ2VPA6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HelqQ2VPA6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HelqQ2VPA6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HelqQ2VPA6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HelqQ2VPA6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HelqQ2VPA6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HelqQ2VPA6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HelqQ2VPA6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HelqQ2VPA6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HelqQ2VPA6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HelqQ2VPA6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HelqQ2VPA6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HelqQ2VPA6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HelqQ2VPA6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HelqQ2VPA6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HelqQ2VPA6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HelqQ2VPA6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HelqQ2VPA6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HelqQ2VPA6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HelqQ2VPA6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HelqQ2VPA6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HelqQ2VPA6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HelqQ2VPA6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HelqQ2VPA6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HelqQ2VPA6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HelqQ2VPA6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HelqQ2VPA6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HelqQ2VPA6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HelqQ2VPA6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HelqQ2VPA6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HelqQ2VPA6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HelqQ2VPA6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HelqQ2VPA6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HelqQ2VPA6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HelqQ2VPA6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HelqQ2VPA6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HelqQ2VPA6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HelqQ2VPA6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HelqQ2VPA6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HelqQ2VPA6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HelqQ2VPA6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HelqQ2VPA6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HelqQ2VPA6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HelqQ2VPA6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HelqQ2VPA6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HelqQ2VPA6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HelqQ2VPA6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HelqQ2VPA6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HelqQ2VPA6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HelqQ2VPA6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HelqQ2VPA6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HelqQ2VPA6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HelqQ2VPA6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HelqQ2VPA6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HelqQ2VPA6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HelqQ2VPA6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HelqQ2VPA6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HelqQ2VPA6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HelqQ2VPA6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HelqQ2VPA6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HelqQ2VPA6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HelqQ2VPA6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HelqQ2VPA6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HelqQ2VPA6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HelqQ2VPA6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HelqQ2VPA6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HelqQ2VPA6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HelqQ2VPA6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HelqQ2VPA6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HelqQ2VPA6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HelqQ2VPA6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HelqQ2VPA6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HelqQ2VPA6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HelqQ2VPA6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HelqQ2VPA6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HelqQ2VPA6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms